..續本文上一頁根本願也。
所謂發願者，即普通所謂立志，志既立定，則抱有志者事竟成之決心，雖赴湯蹈火亦所不辭，以達到其目的爲止。如普通人入學校，進教會等，亦須立志願書，方能允可。志之所在，爲成功建業之本因，故立志願者，誠人生先決之問題也。諸佛菩薩因地發願，亦複如是，誓願既定，雖經艱難困苦而必具不屈不撓之犧牲精神，實現其所志之目的。但其所以與普通立志不同者，以諸佛菩薩因地中發上求佛智，下化迷情之願，皆從清淨心中出發。謂由五遍行中思心所，五別境中欲心所、勝解心所、慧心所，十一善中信心所等以成，非但別境之欲也。
又稱爲誓願者，誓爲誓約，正明志願既立，複以誓約束，則非志願完成不可。故平常所謂人之患者，患不立志，若志既立，必定成功。今菩薩既立衆生無邊誓願度等志願，雖經若幹波折違礙，亦必有達到目的之一日。如江河百川之水，雖經山丘土石之阻而終彙于海，所謂“溪澗豈能留得住，終歸大海作波濤”也。故自諸佛菩薩之通願觀之，其所發誓願無量無邊，而本此誓願修行所證之果，其施設普濟群生之法門，亦無盡無滯也。自其願上之誓以觀之，例如彌陀之願成佛時，名稱普聞，若聞我名皆得往生，若不得成，誓不成佛；則今日彌陀既已成佛，其所誓亦必成矣。又如水陸儀軌上每有“惟願不違本誓”，此不違本誓，爲保持人格信譽之要素，若違背本因誓願，則即爲自欺矣。即如中國古來之聖賢，凡有所爲，務必躬行實踐，成其志行。故學佛者，亦須先發誓願，範圍自己，督促自己，鞭策自己也。
複次、雖有本願，必藉功行圓滿，方使其本願之得遂；如發衆生無邊誓願度等四弘誓願，則須修六度、四攝等諸勝行，功成果圓，方能實現衆生無邊誓願度之理想；若無功行，有願徒然！故平常謂發菩提心，修菩薩行：此菩提心，即上求佛道、下化衆生之心；此菩薩行，即四攝六度等萬行。四攝者：布施、愛語、利行、同事。六度者：布施、持戒、忍辱、精進、禅定、智慧。必藉此等功行圓滿，方得果位莊嚴妙用，是即所謂功德也。功德、謂功家之德；但有功所顯德，與功所生德：所顯德者，即無爲性德，如如本具，但因妄想執著覆蔽而不能彰顯，若修六度等功行圓滿，掃蕩無明障翳，即顯于本然性德也。所生德者，即如修六度萬行，由布施故，得種種法財珍寶，乃至由禅定故得種種自在妙用。故由功行有所顯德，亦由功行有所生德；而此二德，鹹由本因地誓願所起功行而成就者。故藥師琉璃光如來之依正莊嚴果德，亦由因地本願策發功行以圓滿焉。
5.經 梵語修多羅，或素怛纜，此翻爲經；直譯其義爲線。如布帛須經緯線而織成，散亂之花，線能貫穿；正喻法界諸法，生佛平等，不增不減，而衆生迷故散亂忘失，不成體系，諸佛如證而說故，如握網之綱，貫穿而顯現也。又、修多羅廣則總包一切經典，狹則唯局十二部中修多羅部之直說者。又、佛時藉音言以聞法，初無寫本，佛後由衆弟子之結集，貫穿佛語，猶線串花而成經本也。經在中國訓常，訓法。蓋古聖先賢之言教，足令萬世奉爲圭臬，而四海效作模範者，則謂之經；此與佛之修多羅相當，故譯爲經。又譯契經，有契理、契機二義：契理者，佛之說法，皆與真理契合，爲實相印與叁法印印定，方可稱經，否則、說同魔外。契機者，佛所說法爲使衆生開示悟入佛之知見，若不能悟他，等于廢話，故須契機方得其用也。
乙 合釋
1.藥師琉璃光 藥師琉璃光，正是此佛之別號，雖是別號，而此藥師琉璃光，亦正爲一切佛及菩薩共證共修之悲智。由大悲心故，倒駕慈航，應病施藥，而爲大藥師，度無明顛倒之衆生，出生死險惡之苦海，故成其爲大悲藥師。但獨悲不能成事，須藉琉璃光之無分別妙智，方可成滿因中不思議之本願，而發生不思議之德用。由不思議之大悲，起無分別之妙智，由無分別之妙智，成不思議之大悲，則藥師琉璃光之義彰矣。此以藥師與琉璃光爲並列之悲與智，即六合釋中之相違釋；若藥師之琉璃光，即依主釋；若藥師即琉璃光，亦持業釋。
2.藥師琉璃光如來 藥師琉璃光如來者，藥師琉璃光，爲此佛別名；如來，爲諸佛之通號。其能有被稱爲如來之資格者，皆已五住究盡，二死永亡，位登妙覺極果，化被九界群機者。而此藥師琉璃光，放諸佛自覺覺他之本領，應具盡具，故亦稱爲如來。但藥師琉璃光爲別義，如來爲通義，攝通就別，依別名通，故今言藥師琉璃光之如來，乃依主釋也。
3.藥師琉璃光如來之本願功德 藥師琉璃光如來之本願功德者，正顯此經乃說藥師之本願功德者；謂本因地中所發之誓願而成果位之萬德莊嚴，此亦爲六合中之依主釋。故經中文句，可合可分，分則每一文句各自獨立，以表其義；合則如線串珠，可貫穿攝持也。
4.藥師琉璃光如來本願功德之經 藥師琉璃光如來本願功德之經者，此以能诠之言教爲經，所诠之義理，爲藥師琉璃光如來本願功德。所诠義別，唯局此經；能诠教通，通于經律論叁藏中之經藏；依別名通，依主釋也。若從廣義言之，一切諸佛之教理行果，皆名爲經；故此所說藥師佛之義理行果，亦即是經。如此、則藥師琉璃光如來本願功德即經，亦持業釋，故曰：藥師琉璃光如來本願功德經。
叁 稽譯史
唐叁藏法師玄奘奉诏譯
此稽譯史，即考此經譯來之曆史。佛經皆須考其譯史者，明其來源，方可證信。中國之佛經皆出翻譯，因佛降生于中天竺，當時以音聲說法，原無經典，後經弟子結集，始有梵本文字。又印度文字，亦極複雜，而其古來最通用者，厥唯梵文，故中國經典，多譯自梵文。但亦有其他文字，如南方之巴利文等。故中國之經典，有自梵文譯來，有自巴利文譯來；而大乘經典，多譯自梵文。亦有從印度先傳丘慈、于阗等國，而間接譯來中國者，由梵語而成華言。但此經在中國曾經五譯，今此流行本言唐叁藏法師玄奘奉诏譯，正爲五譯中之第四譯。今略明五譯之概史于下：
甲、晉帛屍梨密多羅譯 在六朝之初，東晉之時，有西域叁藏名帛屍梨密多羅者，此雲“吉友”(善友之義)，初翻此經，名佛說灌頂拔除過罪生死得度經。但無獨立本，乃附于佛說灌頂大神咒經中。此經古有十二卷，今在清藏合訂六卷，而屬于最後一卷。此帛屍梨密多羅叁藏，爲中國密宗經典初翻之人。普通謂密典至唐善無畏、金剛智、不空等時始有，其實唐前已有；如大灌頂神咒經、大孔雀王經等，皆屬密部。又謂唐前爲雜密，言其未成系統，但此爲唐人言論；其實、東晉吉友等翻大灌頂等經，亦爲中國密典之叢書；而此師爲中國唐前之極重密宗者，亦見其所從來之西域，其時密部已極流行，故翻譯時，將此藥師經，亦攝入大灌頂神咒經之最後品。故此大灌頂經，亦猶大寶積經之糅集多經而成，在此師譯附于大灌頂經觀之，固視爲密宗之經典也。
乙、宋慧簡譯 此在東晉後，南北朝之劉宋孝武帝時代，有慧簡法師，在鹿野寺再翻此經。名藥師琉璃光經。今藏經中已佚此本，但古大藏目錄中，尚載其名。又在達磨笈多第叁譯之序文上，亦敘述其事，故信有此譯也。
丙、隋達磨笈多譯 在六朝之末，隋文帝大業十一年時，達磨笈多複翻此經。達磨譯法，笈多譯行，即法行叁藏所譯。法行爲主譯，尚有余人爲助譯，故其經上表法行等譯。名佛說藥師如來本願經。序因慧簡之譯，于梵文、華文未善，故作第叁譯雲。
丁、唐玄奘譯 今本題唐叁藏法師玄奘奉诏譯，即此第四譯是。玄奘叁藏于唐太宗貞觀初年間，因感經典義理殘舛，發願入印求法，所謂策杖西遊，周曆諸國。居印度十七年，遍學大小乘教典。至貞觀二十年外，重回中原，從事譯經。在中國譯經史上，翻譯最多，亦最正確。今此藥師琉璃光如來本願功德經，即其所譯。玄奘其名，叁藏法師乃所稱之德號；以其能通徹經律論叁藏之法，依此爲師，且能將叁藏法廣爲宣揚爲人天之師，故名叁藏法師。其譯經曆唐太宗、唐高宗兩朝。奉诏譯者，即奉太宗或高宗之诏，建立譯場。其翻譯時，有度語者，筆受者，證義者，潤文者多人，而以唐叁藏爲主，故標以斯名耳。
戊、唐義淨譯 自唐太宗後，經過唐高宗，至武則天朝，約在玄奘叁藏後二叁十年間，有義淨法師者，踵法顯之芳躅，慕玄奘之高風，遍遊印度，歸而複譯此經，名曰藥師琉璃光七佛本願功德經。然玄奘既譯此經，義淨何須再譯？其所以重譯者，藥師佛雖與奘譯相同。而余六佛，則爲奘譯所無，故須重譯。其譯本今在藏中，上下兩卷，七佛本事，備述其中。
總觀其全文，初亦由曼殊室利菩薩，請佛說諸佛名號本願功德，釋迦佛乃告曼殊室利：東方去此，過四殑伽河沙佛土，有世界名曰無勝，佛號善名稱吉祥王如來，彼佛國土，清淨莊嚴，乃至初發心時，發八大願等；此爲第一大段之文。
複告曼殊室利：東方去此，過五殑伽河沙佛土，有世界名妙寶，佛號寶月智嚴光音自在王如來，乃至彼佛初發心行菩薩道時，亦發八大願等；此爲第二大段之文。
複告曼殊：東方去此，過六殑伽河沙佛土，有世界名圓滿香積，佛號金色寶光妙行成就如來，乃至彼佛初發心時，發四大願，及見衆生苦惱，爲除業障，即說神咒等；此爲第叁大段之文。
複告曼殊：從此東去，過七殑伽河沙佛土，有世界名無憂，佛號無憂最勝吉祥如來，乃至彼佛世尊，行菩薩道時，發四大願等；此爲第四大段之文。
複告曼殊：從此東去，過八殑伽河沙佛土，有世界名法幢，佛號法海雷音如來，乃至彼佛行菩薩道時，發四大願等；此爲第五大段之文。
複告曼殊：東方去此，過九殑伽河沙佛土，有世界名善住寶海，佛號法海勝慧遊戲神通如來，乃至彼佛行菩薩道時，亦發四大願等；此爲第六大段之文。以上六佛，初二佛各發八願；後四佛，各發四願；此總爲卷上之文。
其卷下之文，即從此娑婆東去，過十殑伽河沙佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光…
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