密教以不動明王爲中尊建立之曼荼羅。(一)依大日經卷二息障品、大日經疏卷九載，不動明王之本曼荼羅即是叁角曼荼羅，其中爲黑色，持誦者觀想己身作不動明王之像。此一作法具有二意：(1)觀想不動尊在圓中，而踏于大自在天上。(2)觀想自身爲不動尊，即以本真言印加于大自在天，而踏其上。在叁角中，畫大自在天爲障者之形，然後入于其中，以左腳踏大自在天頭頂，以大忿怒形加之，彼當應時退散。
(二)依聖無動尊安鎮家國等法，在八輻金剛輪中央畫二臂之不動尊，身長八指，右手持智劍，左手執罥索。輪內八方各畫四臂之大嚴忿怒身，輪外八方畫叁股金剛杵之頭。
另有依底哩叁昧耶不動尊威怒王使者念誦法所繪者。又十二天曼荼羅及十天曼荼羅等，均于中央畫四臂之不動尊，故亦稱爲不動曼荼羅。［不動使者陀羅尼秘密法、大日經義釋卷七、大日經疏演奧鈔卷叁十二］