即以如意輪觀音爲中尊而建立之曼荼羅。有諸多異說：(一)據如意輪陀羅尼經壇法品所載，此曼荼羅分爲內、外二院，內院中心畫叁十二葉之開敷蓮花，花臺上安置二臂如意輪聖觀自在菩薩，四方爲圓滿意願明王、大勢至菩薩、馬頭觀世音明王、四面觀世音明王，四隅則爲白衣觀世音母菩薩、多羅菩薩、一髻羅刹女、毗俱胝菩薩；外院四方爲天帝釋、焰魔王、水天、多聞天，四隅爲火天神、羅刹王、風天王、大自在天王；又其間有日天子、月天子、地天神、大梵天王、阿素羅王、始縛婆歌明王。
(二)據別尊雜記卷十八所載，內院有大輪圓，圓之中心爲二臂如意輪觀音，其四方、四隅安置圓滿意願明王等八大觀音（如同前述），大輪圓外之四隅則畫嬉、鬘、歌、舞等內四供養菩薩；外院四方爲鈎、索、鎖、鈴等四攝菩薩，四隅爲香、花、燈、塗等外四供養菩薩；又外院東面爲月天、多聞天，南面爲自在天、梵天、帝釋天、火天，西面爲地天、焰魔天，北面爲羅刹天、日天、水天、風天。
此外，七星如意輪秘密要經所舉之七星如意輪曼荼羅，中央亦以如意輪觀音爲中尊，然其周圍則安置北鬥七星及鬼子母神。