奉行《瑜伽師地論》等教說爲宗派的，稱爲瑜伽行學派，又作瑜伽宗，這是與印度中觀學派對立的大乘教派。公元五世紀之間，傳說在兜率天宮的彌勒菩薩，于中印度阿瑜陀國阿瑜遮那講堂，爲無著論師說《瑜伽師地論》、《分別瑜伽論》、《大乘莊嚴經論》、《辨中邊論》、《金剛般若論》。無著秉承彌勒之說，並著《攝大乘論》，《顯揚聖教論》等論著以弘揚之。繼而世親論師轉小入大，撰《十地經論》、《唯識叁十論頌》等以光大其說。世親之弟子陳那亦作《觀所緣緣論》、《入瑜伽論》等以宣揚瑜伽思想，複著《因明正理門論》而定因明之論式。同時複有親勝、火辨二大論師注釋世親之《唯識叁十論頌》。相繼而起者另有德慧、安慧、護法、難陀、清辨、戒賢、淨月、勝友、最勝子、智月、法藏、智光、無性、親光等諸師，相繼發揮叁性中道之旨，提倡觀行萬法唯識的妙理，以悟入真如之性。
瑜伽行學派本與中觀學派世代對立，彼此論難。然八世紀初，寂護及弟子蓮華戒融合中觀自立派與瑜伽派的思想，成立瑜伽中觀自立派。此派思想，有關勝義谛者乃采用中觀自立派的論點，有關世俗谛者則依據瑜伽唯識的立場。八世紀後，印度佛教傳入西藏，西藏佛教改革者宗喀巴以甚深觀、廣大行，意圖綜合般若中觀與瑜伽唯識兩派。八、九世紀以後，瑜伽派爲中觀派綜合攝取，獨立學派不複存在。在我國，以北涼昙無谶所譯的《菩薩地持經（即瑜伽師地論菩薩地）》、劉宋求那跋摩之《菩薩善戒經》，及北魏菩提留支、勒那摩提等之《唯識二十論》、《十地經論》等爲瑜伽派經論的最早譯介。其後，我國的瑜伽派漸分爲地論宗與攝論宗；前者系以《十地經論》爲主，後者則以《攝大乘論》爲主。兩宗雖同立“八識緣起”之說，然地論宗以阿賴耶識與如來藏心同視爲真識，攝論宗則視阿賴耶識爲妄識，故別立第九阿摩羅識，此爲兩宗論點最大的歧異。直至唐代，玄奘自印度遊學回國，譯出《瑜伽師地論》、《顯揚聖教論》、《辨中邊論》等論，又糅譯十大論師的《唯識叁十頌釋論》爲《成唯識論》等書，乃展開該學派的教說，其弟子窺基複加以宏揚，而有大乘唯識宗的創立。參閱“法相宗”、“唯識宗”條。 - 于淩波居士著