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這是心經中的名句，盡人皆知，但誤解者多。此須自四大、極微說起。四大又稱四大種，一者地大種，二者水大種，叁者火大種，四者風大種。古代印度的哲學家，認爲這是構成一切物質的基本原素，此稱爲“能造四大”，而一切物質稱爲“所造四大”。把任何物質分析到最後的最小單位，稱爲“極微”（參閱四大、極微條），古代印度的小乘佛教和外道，都以極微爲實在，爲色法的基本質料；而大乘佛教則以極微爲假法，根本不能成立。唯識宗亟力破遣極微，其故在此。那麼，物質的基本質料究竟是什麼呢？《楞嚴經》卷叁，佛對阿難說：“汝觀地性，粗爲大地，細爲微塵，至鄰虛塵，析彼極微，色邊際相，七分所成。更析鄰虛，即實空性。阿難，若此鄰虛，析成虛空，當知虛空出生色相。……”在這一段經文中，佛陀告訴我們，把物質分析成極微，再細分成“鄰虛塵”——接近虛無的微塵。再分析下去“即實空性”——就成爲虛空。最後告訴我們說：“當知虛空出生色相”。
人類古老的觀念，認爲“大地是萬物之母”——萬物自大地生出的。但是，大地自何處而來的呢？佛陀告訴我們，山河大地——正確的說，“宇宙”、無量數的星球、星系、星雲，全是自虛空生出來的。換句話說，色相——一切物質之相，全是自虛空生出來的。虛空中生起宇宙，有其科學上的證據。科學知識告訴我們，一切物質，皆由分子組成，而分子是由原子組成。例如水分子是水的最小單位，水分子再加以分析，可分析爲兩個氫原子和一個氧原子，分析至此已不再是水，只是“原素”。基本原素有一百零五種（近年又有新元素發現），如金、銀、銅、鐵、氫、氧、氮、氦等，也就是有一百零五種性質不同的原子。原子（Atom）的原意是不可分割者，過去科學家以此爲最後的質點。但是由于科學的進步，發現原子是由帶有正電、質量比電子大的原子核，及圍繞原子核的電子所組成。原子核的半徑爲原子的十萬分之一，而質量卻占原子的百分之九十九。原子核是由質子和中子兩種粒子所組成，質子帶正電，中子不帶電，其質量與質子相等；而電子帶負電，其質量只有質子一八叁六分之一，以光速繞原子核旋轉。每一原子的質子和電子數目相同，以維持平衡。這樣，就說明原子可以分析，不是最後質點。近年科學突飛猛晉，目前所知，物質最基本的組成單位是輕子、光子、誇克 （Quark）。原子以下的次原子層，不是物質，只是“能”。“能”存在于何處呢？能即存在于虛空中。
紐約世界宗教研究院院長沈家桢博士，在其《金剛經的研究》一書中說：“在愛因斯坦以前，科學家說世界上的一切，可以分爲兩大類，一是物質，二是能。物質之間可以互相變換，譬如水可以變冰，冰也可變水；能之間也可以互相變化，如電可以變光、變熱，光、熱也可以變成電。可是物質和能是兩件基本元素，不能互相變換。一直到愛因斯坦用數學計算，發現物質和能也可以互相變換。這就是著名的E=MC2 方程式。最初很少人相信這個說法，直到原子彈（物質）爆發後（變成大量的熱和光），再也沒有人懷疑物質也是能的理論了。如此一來，宇宙間的一切，都是“能”，在各種不同條件下變現出來的現象。”沈博士在同書中續說：“在二十世紀初期，人們認爲原子是宇宙間最小的因素，小到不能再分，它好像是一個實體的單位；直到近百年來，由于核子能的發現，才知原子也是人假定的一種“能”的表象而已。其實這些都是“能”，因種種因緣而顯現出來的表相。”能的英文稱爲 Energy， 這是人定的一種名詞，是人類用來表示這種作用的一種概念，至今尚沒有嚴格的定義，說明 Energy 究竟是什麼。但是，以佛學的眼光來看，此“能”就是唯識學上所稱的“功能”（種子），也就是宇宙萬法生起的根荄。
沈博士在上第二段文字中續說：“……其實這些都是“能”，因種種因緣而顯現出來的表相。人類就因爲這種變化多端的表相，而生出複雜的情緒，造成社會的喜怒哀樂。依佛法講，業報因果，生死輪回，無不由此而生，實則都是能的變化，並無實質。”《般若心經》的名句：“色不異空，空不異色，色即是空，空即是色。”這正說明，物質現象和虛空（正確的應稱爲“空性”），虛空和物質現象，是不一不異，現象是萬法之相，虛空是萬法之性。此虛空，不是一無所有的“頑空”，而是能夠生起妙有的“真空”——即所謂“非有之有，稱爲妙有；非空之空，稱爲真空。”虛空中的“能”生起現象界，是“事”、是“相”；如果自“理”、自“性”上說，“真空妙有”，就是唯識叁性中的圓成實性。此圓成實性，是遠離我法二執所顯現的真理。因遠離二執，故稱真空；這不是小乘佛教空、有相對的“空與有”（真實之有），這是與真空相對之有，稱爲妙有。以其爲真空故，緣起之諸法宛然；以其爲妙有故，因果之萬法一如。這就是“色即是空、空即是色”的意義。故知真空與妙有，並非有別有異，因爲一切的存在（五蘊），均由各種條件（因緣）和合而生起。因緣和合之法，沒有固定不變之性（無自性），無自性即沒有實體，故因緣和合之法只是“假有”的存在。所以，真空不是虛無，妙有不是實有。“色即是空，空即是色。”一切都是“能”的變化。 - 于淩波居士著