指密教十六菩萨，有二种。(一)又作慧门十六尊。指金刚界曼荼罗羯摩会三十七尊中，阿■佛以下四方四佛之各各四亲近菩萨，特称为十六大菩萨。即：(一)　　东轮阿■佛之四亲近，即金刚萨埵、金刚王菩萨、金刚爱菩萨，及金刚喜菩萨。彼等皆以持戒忍辱而成就菩提心功德。(二)南轮宝生佛之四亲近，即金刚宝菩萨、金刚光菩萨、金刚幢菩萨、金刚笑菩萨。彼等皆以无执着之布施而成就福德庄严功德。(三)西轮阿弥陀佛之四亲近，即金刚法菩萨、金刚利菩萨、金刚因菩萨、金刚密语菩萨。彼等皆以正定大慧而成就智慧功德。(四)北轮不空成就佛之四亲近，即金刚业菩萨、金刚护菩萨、金刚牙菩萨、金刚拳菩萨。彼等皆以利他之精进而成就事业方便功德。［金刚顶瑜伽中略出念诵经卷三、金刚顶瑜伽三十七尊出生义］

　　(二)指表贤劫千佛因位千位菩萨之十六菩萨。其十六菩萨之名，出自金刚顶瑜伽中略出念诵经卷三、金刚顶经卷一、贤劫十六尊轨。（参阅“贤劫十六尊”6175）

　　（名数）涉于显密二教，有十六菩萨。

　　大日经宗，于地前建三劫，地上立十地，以示阶级。金刚顶宗，直修直证，不立位次，但于地上立十六大菩萨，以为行位。东方发心门四：萨、王、爱、喜，南方修行门四：宝、光、幢、笑，西方菩提门四：法、利、因、语，北方涅槃门四、业、护、牙、拳。然十地十六菩萨，特开合不同，法相稍异耳，但二者相合，亦有二种不同。

　　┌萨┐　　┌萨┐
　　│王│　　发　　│王│
　　初地┤　　├金刚部　　菩萨心门　　初地┤　　├阿赖耶识───大圆镜智
　　│爱│　　心　　│爱│
　　└喜┘　　└喜┘

　　二地──光┐　　二地─光┐
　　三地──宝│　　修　　三地─宝│
　　├摩尼部　　大福德门　　四地┐　　│
　　四地──幢│　　行　　├幢├末那识──平等性智
　　五地──笑┘　　五地┘　　│
　　　六地┐　　│
　　　├笑┘
　　　七地┘

　　┌法┐　　┌法┐
　　六地┤　　│　　八地┤　　│
　　└利│　　菩　　└利│
　　├莲华部　　大智慧门　　├意识──妙观察智
　　┌因│　　提　　┌因│
　　七地┤　　│　　九地┤　　│
　　└语┘　　└语┘
　　┌业┐　　┌业┐
　　八地┤　　│　　涅　　│护│
　　└护├羯磨部　　大精进门　　十地┤　　├前五识──成所作智
　　九地─牙│　　槃　　│牙│
　　十地─拳┘　　└拳┘ - 明·杨卓