二、心身病及生理性疾病的佛法心理治療
精神心理原因導致的“心身病”，有癌、消化性潰瘍、過敏性結腸炎、高血壓、冠心病、支氣管哮喘、皮膚病等多種。據有關統計，在當今所有疾病中，身心病略占泰半，或曰百分之七八十的疾病與心理病因有關。
佛教的歸依、發心、祈禱、禮佛、誦經、念佛、持咒、坐禅、修觀、經行、布施、放生等修行方式，可以治療精神心理疾病者，也都可以用來治療心身病和生理性疾病，或有助于各種疾病的治療康複。《雜阿含》卷叁七第 1024 經載：比丘阿濕波誓病苦，佛爲說法，心得解脫，“歡喜踴躍故，身病即除”。同經第 1046 經摩那提長老告阿那律比丘：
我住四念處，專修系念故，身諸苦患，時得休息。
歸依發心，可以使病人的心靈獲得安頓，增強戰勝疾病的精神力量。即佛教徒常用的行禮方式雙手合十，據美國醫學家史迪文·拉姆研究，也有使人最大限度地進入全身心徹底松弛、從而健身祛病的效用。禮佛誦經、念佛持咒、布施放生等修行，可消除業障，積集福德，使病人增強戰勝疾病的信心，卸除心理負擔。至誠忏悔，最能消除負罪感、內疚等心理包袱，對治療因此而致的疾病極有助益。布施、放生，不僅可增長病人的福壽，而且可通過精神上的充實感、心理包袱的卸除和慈悲心、愛心的增強，加強其機體的免疫力。佛經載：摩揭陀國阿阇世王弑父即位後，心生懊悔，全身生起惡瘡，奇臭無比，百藥無效，醫師耆婆勸其至心忏悔，乞求佛陀加被，佛入月愛叁昧，放光照阿奢世，其惡瘡即愈。即寺院的鍾聲，也有治療作用，古羅馬人即認爲教堂裏的鍾聲能殺菌，治療某些疾病，研究證明鍾聲頻率在25000赫茲以上能治療流行性感冒等傳染病，提高免疫力；100－2000赫茲的鍾聲響亮清脆，能增加毛細血管和淋巴流量；40－100赫茲的鍾聲渾厚，能緩解緊張。
《摩诃止觀》卷八將所有疾病分爲六種，第六“業病”，有腫滿黃虛等多種。業病或者是前世殺生等惡業的果報；或者由今生的殺、盜、淫亂、酗酒等不良行爲引起，“或今世破戒，動先世業，業力成病”；今生的修行也可以引起疾病，“若今生持戒，亦動業成病”，經論中說修行好者可以轉後世應受的叁惡道重報爲今生病患而輕受。業病由五根而造，相應地亦由五根而發：
若殺罪之業，是肝、眼病；飲酒罪業，是心、口病；淫罪業，是腎、耳病；妄語罪業，是脾、舌病；若盜罪業，是肺、鼻病。
今日流行的癌、愛滋病，多屬業病，即不良行爲導致的疾病。業病一般非僅用藥物所能治愈，“當內用觀力，外須忏悔”。觀力，指用佛教的見地深觀病由業生，業由心起，業力、心性本空，從而徹底放卸潛意識中造成疾病的包袱。當代美國露薏絲茜患癌症後，根據佛法，消除憤怒以“改變自己製造癌細胞的心理系統”，結果完全治愈。她因此虔信佛教，在洛杉矶等地建立治療中心。其《生命的重建》中說：
如果把憎恨融化，甚至可以使癌症痊愈。
雷久南博士 1991 年在美國加州成立“琉璃光養生康複中心”，運用佛教的觀點和方法，提出“身心靈整體健康”思想，以開心、天然素食、奉行五戒十善、放生、拜忏、坐禅、念誦真言，加上服用小麥草汁，治愈了許多癌症病人。其念誦七字真言方法爲：誦時逐一觀想，先想光，再念誦咒音，或想象在天氣晴朗的草原上，踏著柔軟的青草，登上前方平頂八層金字塔，逐層登上時依次觀想紅、藍、黃、綠、桔紅、紫紅、墨藍七種光籠罩自身，至頂層時想吸進具備七色光的太陽光。吸足後下臺階，倒過來逐層觀想墨藍、紫紅等七種光。或根據病情想具有治療作用的光射來治療，如想象用紫紅光複合傷口，用藍光止痛，想象難忘的人在眼前，從自己眉間或心口放出藍光，送給對方，可以溝通感情，治愈感情創傷。七字、七種光、音及其所表意義如下：
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│字音│光色│所表意義 │
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│E │紅色│自在、獨立、領導能力、開創精神│
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│O │藍色│忍耐、慈愛、看得開、放得下 │
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│AH │黃色│喜悅、組織能力 │
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│A │綠色│健康、成長、財富 │
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│AE │桔色│自信心、勇氣、智能 │
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│UU │紫紅│情感康複、靈感 │
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│OM │墨藍│保護作用、萬物同體 │
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在佛教修持法中，禅定最具直接的治病效用，用以治療禅病的禅法，若運用得當，也可以用來治療身心病、生理性疾病，起碼可以作藥物治療的輔助療法。包括佛教禅定在內的“氣功療法”，已被國內外廣泛采用。Padmal de Silva 在一項持續而有系統的研究中發現：坐禅作爲一種精神治療法，已成功地用于治療幹癬皮膚症等生理性疾病。
《西藏醫心術》一書中，根據甯瑪派的傳統，列舉了以光、水、火、風、地治療身體不和諧的禅法：
放松，深呼吸，想象治療力量來源于上前方，若患與熱有關的病，想白色光從力量來源處射出，環繞自己上身，如同磁石吸鐵般吸走疾病，從頭頂出，融入天空。若患寒冷有關的病，想紅光射下，環繞自己腹部和下身，吸走疾病，從足下出，融入地中。若疼痛或有障礙感覺，想其如石頭、棍子、刀、指甲等，再觀想射來的光拔出疼痛。若患腫瘤，想射來明亮、銳利如鐳射般的光，將腫瘤切成碎片，分解成原子，被排出體外。
或觀想甘露般具有藥性的水，從力量來源流下，流經全身，滌去汙穢，解除毒素，淨化身體。想象這水是熱的，稀釋、融化身心障礙；或是清涼的，熄滅灼燒刺疼的病障；水慢慢流過全身，從下門、足底、腳趾出，流入大地。
或觀想具有治療力量的火焰環繞自身，燒掉與冰冷、無生命及能量不足相關的一切疾病。
或想象清淨的風或氣掃去身上循環、呼吸系統的一切毛病及充血症、細胞內的毒素，帶給每一個細胞以健康。想象此風如同體內美妙的音樂，給予放松和健康。
當疾病帶來懷疑、恐懼、痛苦時，想象身體像大地一樣堅實強壯，不可動搖。
禅定修習者還可以通過觀想光、水、火等從力源射到自己手上，掌心向下放在患者身上或病處上方，或輕觸、撫摩患者，想疾病被清除，丟到體外。治療者與患者都必須堅信疾病已被驅除。
淨土宗信徒念佛，自信可以得到佛的加被，消除業障，往生淨土，解除死亡焦慮，自有治療諸病的力量，蓮池大師謂“念佛非止明心，亦無病不治”，他爲患病居士開出叁方：一、對治，以逸治勞(以放松對治緊張)，以舒治郁(以放下對治憂郁)：
逸，非懶惰不簡之謂也，萬緣盡廢，如初生孩子，六識不行，是謂之逸；舒，非散放無忌之謂也，知身世如幻夢，隨緣順受，不被境瞞，和即今病之愈否、身之生死，一並放下，是謂之舒。
二、調攝，節飲食、慎藥餌。叁、正念，觀苦從身生、生從業生，病即苦中之一，其展轉相因，亦複如是。“應孜孜密密，日夕體究，究之不得，只須提一句本參念佛話頭，回光自看，識得此念下落，則惑自破”，惑破則疾病亦輾轉消滅。《印光法師文鈔》教人，念佛不僅最宜治療怨業病,而且能治療外感內傷導致的生理性疾病：
若怨業病，神仙亦不能醫。念佛，便能令宿世冤家仗佛慈力超生善道，故怨解釋而病即痊愈矣。外感、內傷，念佛亦最有益，非獨怨業病有益也。
可歸于心理療法的咒語和祈禱，是佛教用以治病的重要方法。《四分律》卷二七、《十誦律》卷四六列治腹內蟲病等咒。《除一切疾病陀羅尼經》佛告阿難“除一切疾病真言”曰：
怛的也他 尾摩黎尾摩黎 嚩曩俱枳黎 室利末底軍孥黎 嫩奴鼻 印捺啰擬甯 母隸 娑嚩诃
謂誦持此真言，宿食不消、霍亂、風黃、痰壅、咳嗽、痔瘘、寒熱、頭疼、著鬼魅等一切病，即得痊愈。
大乘一般多祈禱東方藥師琉璃光佛以求治病，此佛特以善療衆病著稱。《藥師琉璃光如來本願功德經》佛言：藥師佛在行菩薩道時發十二大願，其中第六願：願來世成佛時若有衆生受盲聾喑啞、攣跛背偻、白癞癫狂種種病苦，“聞我名已，一切皆得端正黠慧，諸根完具，無諸病苦”。第七願：願來世成佛時，若諸衆生“衆病逼切，無救無歸，無醫無藥，無親無家，貧窮多苦，我之名號一經其耳，病悉得除，身心安樂，家屬資具悉皆豐足，乃至證得無上菩提”。經中救脫菩薩說祈禱藥師佛治病之法爲：
爲病人于七日七夜受“八關齋戒”，以飲食衣服等供養僧衆，晝夜六時禮拜供養藥師佛，讀誦此經49遍，造此佛像7軀，每軀像前燃燈7盞，燈大如車輪，晝夜長明49日，造五色彩幡，各長49紮(約3米)，放生49數衆生。可得愈病延命，不遭橫死。禮拜、供養、憶念、祈禱此佛，還有免墮惡道、祛除災疫、往生淨土、消除惡夢、解除怖畏等利益，“隨所樂願，一切皆遂：求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女”。
密教頗重祈禱藥師佛、修藥師佛本尊法、念誦藥師佛心咒以求治病，大藏經中有唐譯《藥師琉璃光如來消災除難念誦儀軌》、《藥師如來念誦儀軌》、《藥師如來觀行儀軌法》等。藏密藥師佛本尊法大略爲：
手結藥師佛印。歸依叁寶。發菩提心。觀想空。從虛空中想象一尊藥師佛出現，其身天藍色，坐蓮花臺，雙手左上右下相疊，二大拇指頭相觸，端一…
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