我們生起煩惱時，整個心都是顛倒執取所緣境，毫無理智可言。比如貪欲，常言說“戀愛中的人十個有五雙智商是零”，就是因爲以貪欲顛倒執取對境，不由自主地顯現清淨可愛之相，沈溺在其中，完全不管也不考慮其它的事。又比如嗔心，《入中論》曾說嗔心可以奪去辨別理非理的智慧，嗔心才生起，就牢牢執取對方的損害相，並且一再強化，自心完全被嗔恚所控，無法回轉。又比如慢心，如果有位農民一夜暴富，成爲世界首富，我慢心必定也會隨之驟起，執著自己是全世界最富有的人，不願放下高大的我相。知道上述內容之後，我們必須結合自身經曆思惟，觀察“自己生起各種煩惱時，是否處于顛倒執取所緣境的狀態？”這樣才能對煩惱倒取所緣的過患，生起真正的定解。
堅固隨眠。
生起煩惱時，會堅固煩惱種子，即令自相續中煩惱粗重的種子進一步轉成上品，難以破壞。
也就是煩惱生起一次，就會加強習氣勢力一次，數數起就會數數堅固，逐漸串習就會變得如生牛皮般，難以逆轉。
同類煩惱令不間斷。
生起煩惱時，會輾轉引發同類的煩惱，令同類煩惱一次次相續轉起。這種同類煩惱相續的過患，極其可怕，每個人應反觀自相續，何種煩惱最爲粗重？如果沒有努力對治，這類煩惱是否會一遇到緣，就反複現起？比如，爲官多年者的言行舉止之間，自然流露出一副官派，只要留心觀察，處處可以看到他傲慢煩惱的現行。
于自于他于俱損害，于現于後于俱生罪，領受苦憂。
“于自于他于俱”是從受害的對象而言，煩惱對自己、對他人，以及對自他雙方都會造成損害；“于現于後于俱”是從損害的時間而言，以煩惱生起今生的罪業，生起後世的罪業，以及今生和後世都會生起的罪業。由于罪業的力量讓人領受身心的憂苦，失去一切快樂。
感生等苦。
以煩惱能引起受生等種種大苦。
這是因爲煩惱是苦因的緣故。“等”字包括老、病、死苦或者生死流轉所攝的叁苦、六苦、八苦等無量痛苦。
遠離涅槃。
煩惱能令相續遠離涅槃的安樂。
因爲涅槃的境界以遠離煩惱，而得名涅槃安樂，如果相續中仍有煩惱隨逐，就不能馬上獲得涅槃安樂。
退失善法。
相續中原有的種種殊勝善法會因爲煩惱而退失。
比如，起一次嗔心，就會燒毀功德林，毀壞多劫布施修福所積累的善法資糧。如果煩惱頻繁而起，就會降低智力、心力，喪失記憶力，退失已有的信心、精進或者修法的境界，原先心底清明，遇事反應靈敏，如今心智蒙蔽，反應遲鈍，這些都是退失善法之相。
衰損受用。
能令資財衰損散失。
起一次煩惱，就會消耗很多福報，若日日起煩惱，最終必定會窮困潦倒，難以維持基本的生活。
赴大衆中，怯懼、無樂及無無畏。
走到大衆場合當中，內心會膽怯、恐懼、慌張，自慚形穢擡不起頭，內心痛苦，無有安樂，不能心無畏懼。
所以煩惱會令自心陰暗、萎縮，相反，如果心無煩惱不造惡，俯仰無愧，就能無所畏懼，正大光明。
一切方所惡名流布，大師、護法、聖者呵責。
惡名會傳遍所有地方，常常被佛陀、護法和聖者們呵責。
臨終憂悔，死墮惡趣。
臨命終時，回憶起一生所造的大惡業，內心就會生起大憂悔，不但如此，而且此身壞滅之後，還要墮入惡趣中。
不能獲得自己義利。
不能證得殊勝的義利。
以下引《大乘莊嚴經論•梵住品》當中的一頌，宣說煩惱的十二種過失——叁壞、六呵、叁過。
《莊嚴經論》雲：“煩惱壞自、壞他、壞淨戒。”
《莊嚴經論》中說：煩惱會毀壞自己、毀壞他人、毀壞淨戒。
這是“叁壞”。壞自者，就是以煩惱造下殺生等罪業，自己今生要遭受殺害或捆縛，後世轉生在地獄等惡趣中，被痛苦摧毀；壞他者，就是損壞他人的生命、財産、妻兒等，毀壞了其他有情；壞淨戒者，就是以煩惱造惡會損壞所受的戒律。
“退損、失利、護法、大師呵、鬥诤、惡名。”
煩惱還會導致戒律的退失，利養的失去，護法惡呵責，佛陀的呵責，戒律清淨者的呵責，以及十方人的呵責。
這即是六呵責：自呵責、他呵責、護法呵責、大師呵責、梵行呵責、十方人呵責。
“退損”對應“自呵責”，以煩惱而退損戒律者會自責：我已經舍棄了聖者們贊歎的善趣之道，反而趣入惡趣之道，我現在已經無藥可救。如是心生憂惱、後悔，極其沮喪、怯弱。
“失利”對應“他呵責”，以前的施主們也想：此人是造惡之人，不是應供之處。因此不再供養他，從此失去衣食資具等利養，生活非常困難。
“護法呵責”，以前具足戒律，未破損時，常受護法神等擁護保衛，現在卻遭到護法的呵責，從此不再護衛他。
“大師呵責”，佛陀也在律藏中以各種方式呵責：“此比丘不是比丘，毀壞了沙門之法，如騾之行，如死屍一般”等。
“鬥诤”對應“梵行呵責”，具足梵行者也說：“他是破戒者，我們不應與他共住。”以這種言語抑貶和诤論，進行製罰、驅擯等羯磨。
“惡名”對應“十方人呵責”，在十方都流傳“某某犯了戒，造了這樣那樣的罪業”。
“他世生難處、失得未得意、獲大憂苦。”
這是叁過：後得的叁種過失。
一“他世生難處”，不但今生要受衆苦，來世還要轉生到地獄等，沒有佛法的無暇之處；二“失得未得”，相續中已有的多聞、持戒、四無量心等功德，以煩惱會退失、毀壞，未有的功德也不能獲得；叁“意獲大憂苦”，內心會生起強烈的後悔與難以擺脫的憂惱愁苦。
未二、計煩惱是怨敵之理
《入行論》亦雲：“嗔愛等怨敵，全無手足等，非勇智如何，彼令我如仆。”
嗔恚、貪愛等怨敵，他們有沒有手足等肢體？一顆微塵也沒有。勇敢和智慧呢？也沒有，煩惱是無明的自性，肯定沒有任何智慧，而且只要現前對治法，它就無法對抗，所以也不是勇士。這樣一個不具形體、沒有智勇的敵人，爲何能讓我如奴仆般俯首聽命，任之使喚？”
“安住我心中，歡樂反損我，于此忍不憤，忍非處 應呵。”
“煩惱怨敵安住在我的心中，形影不離，我給他歡樂，他卻反而以地獄火燒等各種痛苦損惱我，對這樣一個怨敵本不應當忍讓，我卻一再忍受而不嗔恨，這是極應呵責的事。”
首先應當以智慧如理辨別敵友，之後對友人應當感謝，對敵人則不應安忍，應當奮起還擊，不能軟弱，成爲任人支配的懦夫。如果錯誤對待，憤不應憤、忍不應忍，則非常不應理。
一般不具佛法智慧的人，都認爲外敵是真正的怨敵，但是如理衡量所得的結論，卻完全相反。
外敵施害並非無緣無故，肯定是前世損害對方的等流果，按理應當順受，因爲順受可以減免多劫的地獄大苦，是消自己的惡業。另外，外敵損害自己，正好成就自己的安忍波羅蜜多，是極爲難得的逆增上緣。因此，對修行人而言，外敵如如意寶般難得。
但煩惱恰恰相反，煩惱只會損壞自己的善法資糧，如同盜賊，將相續中的功德財富洗劫一空，而且以煩惱造作惡業，必定會引生現世與後世的大苦，損害自他，喪失一切安樂，所以對它安忍極不應理。蘭仁巴說：“世人將應作親人的衆生視爲仇敵，將傷害自己的煩惱反而不當作仇敵，這以佛法而言，是認識上的對錯顛倒。”
以下比較內外敵人所作損害的程度。
“一切天非天，設與我作敵，彼不能令入，無間大火中。此大力惑敵，若遇須彌峰，且不留灰塵，能刹那擲我。”
“即便所有的天與非天，一起與我爲敵，最多也只能讓我失去一世的生命，只要自己不造地獄之業，外敵不可能將我擲入無間地獄的大火中。但勢力強大的煩惱敵，卻能在刹那之間，將我抛入無間地獄的烈火中，即使須彌山王遇此烈火，也會被焚盡無余，不留些許微塵。”
再具體思惟此內容：
外敵是盡法界的所有天與非天，數量之多，可以布滿整個虛空界，而且具有大威勢。然而，即便此等外敵使用寶劍、金剛等殺傷力最大的武器，以最殘酷的刀剮、車裂等手段加害我，又能如何？最多將我身體毀成粉末，斷我一世性命。
而煩惱敵的危害，卻遠遠不止于此。比如，在煩惱發作時，毀謗上師和正法，或者辱罵僧衆等，雖是刹那所造惡業，卻足以將我抛入無間地獄，感受烈火焚身之苦，彼時不見色身，唯聞哀嚎之聲，如此刹那不息之苦，需要持續無量劫，從地獄脫免後，還要墮爲餓鬼、旁生，乃至作人也要感受痛苦的等流果。
比較這二者，就可以知道，縱然彙集所有天與非天外敵的力量，相對煩惱的損害力而言，只是九牛一毛而已。《別解脫經》說：“如果遇到毒蛇，不過喪命而已，然未對治煩惱，觸犯戒律，須十萬劫中在地獄受苦。”
再比較內外敵人的爲害時間。
“如我煩惱敵，長時無始終，余敵皆不能，至如是久遠。”
“煩惱敵長期無始無終地盤踞在我心中，只要我沒有對治，他就會不斷損害我，其他怨敵都不能如此長久地損害我，最多數十年與我爲敵。”
煩惱損害我們的時間確實沒有初際，比如，現在生起的一念貪欲，一定是前面貪欲的等流，而前面的貪欲又是源自再前面的貪欲……，如此便可推知，一念貪欲實際是從無始相續而來。對凡夫而言，出世間的寂靜可以說一次都沒有夢到，可是對煩惱卻再熟悉不過了，無始以來，始終盤存在心中，若還不能認識，則就太沒有自知之明了。
而且如果不加以對治，煩惱仍然會盤踞在心中，一遇境緣就會發作，每一次都是讓我們焦頭爛額之後，才肯罷休，而且一次又一次，不會自動終結。所以，若未生起對治，煩惱加害我們的時間也沒有後際。
由此可見，煩惱傷害我們的時間太漫長了，如果有外敵在億萬年中與我們爲敵，尚且會覺得鬥爭漫長得讓人恐怖，而煩惱損惱我們又何止億萬年，身心被它控製的時間，真是無邊無際。因此，世上最殘酷、最長久的敵人唯一是心中的煩惱，受生以來，日日受其傷…
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