全称二种种子。真言之阿等一字，生无量之义，譬如草木之种子，故称种子。瑜只经疏卷二（大六一·四九五上）：“佛部以豙（阿）为种子，成率都婆；莲花部以高（啰）为种子，成八叶莲花（中略）若秘密法品以逘（娑）为莲花部种子；金刚部以釯（缚）为种子，成五股金刚。”

唯识家言，种子是由前七转识熏习所成，与能、所熏不可分割（前七识为能熏，第八本识为所熏），而表现为体与相、因与果之关系。亦即种子依附在本识体上，成为本识相分之一分；同时种子随逐本识潜滋暗长，一遇现缘引发，便腾跃而生，现起转识，是之谓由种子生起现行。譬如人体之行动，口中之语言，心里之意想，都能印在心中，称为业，或称种子，遇缘之助力即能发起现行。　　

　　(一)约唯识宗言，依种子之性质，分为二类：(1)名言种子，系依名言熏习第八识之种子，乃为一切善恶诸法显现之亲因缘。(2)业种子，第六意识善恶业之种子，具有助长其他羸弱、无记种子现行之功能。　　

　　(二)依种子之生起而分，有二，即：(1)本有种子，即无始以来，在第八识中产生蕴处界之功能者。(2)新熏种子，即无始以来，由现行之前七识，熏习第八识后所聚集染净之种子。　　

　　(三)依漏之有无，复可分为有漏种子与无漏种子二种。［成唯识论卷八］（参阅“种子”5863）　　

　　（名数）一、名言种子，为现行一切善恶诸法亲因之种子。善种子生善法，恶种子生恶法，无记种子生而无记法，乃至由色种生色法，由心种生心法等，依附于第八阿赖耶识则而为一切诸法之亲因者是也。名之为名言者，或自发名言，而诠显色心之诸法，于自心之前，反现彼诸法之相分，而熏彼诸法种子于阿赖耶识，或闻他之名言所诠色心之法，于自心之目前反现其相分，以熏彼种子于本识。盖以名言为介成此种子之新熏，故谓之名言种子（是表义名言之义）。又，名言种子者，不特介能诠之言语而熏习之，凡一切之心心所，缘诸境时，亦反现其诸境之相分于心前，以熏其种子于本识也。如此依心心所缘境而熏成其种子者，亦名名言种子。名之为名言者，以心心所缘境时，能缘之心，了显所对之境，恰如名言诠显诸法之体义也，因是又名之为显境名言。此中第一种之表义名言，限于第六识，以名言缘名言，唯为第六识相应之寻伺力也，第二种之显境，通于于七识以了所缘之境而熏种子，通于一切之心心所也。但第八识为所熏处，自无能熏之用。二、业种子，为第六识相应之思心所，作善恶之业，熏习第八识之种子。业者，造作之义，造作善恶所熏，善恶之种子也，此思心所之种子，有二功能，一为自生思心所之功能，名言种子也，二为助他羸劣无记之种子，使生现行之功能，此名为业种子，盖生自果者，非为业种，助他果使生之功能，乃名为业种子也。其助他果之法，第八识为三性中极劣无记之识体，故能生之名言种子，亦为羸劣无记之种子，自无生果之力用，然依第六识相应之思心所造作五戒十善等善事之力，使彼第八识无记之种子，决定可生于当来善趣之功能，为彼之业力所助，自生善起之无记之果也。故名言种子通于八识，且通于三性，业种子局于第六识之思心所，且局于善恶之二性，以无记羸劣，无助他之功能也，又思心所，兼名言业种之二能，他之心心所法，惟有名言种子之功能而已。见唯识论八，百法问答钞三。