..续本文上一页密法，开辟道场。宗派兴起后，宁玛、萨迦、噶举和觉囊等教派势力相继延伸到这里，建立了一批颇具规模的寺院。十四世纪初，格鲁派传入阿坝地区，宗喀巴弟子查古·阿旺扎巴和绒巴·结格巴(格敦坚参)先后在这里传教，把一些苯教寺院改宗格鲁派，并新建了一批寺院，开展宗教活动。随着格鲁派统治地位的确立，其他教派越来越多的寺院改奉格鲁派，使格鲁派寺院约占当地寺院总数的百分之五十以上。例如，金川县南部的金川寺(雍仲拉顶寺)原宗苯教，清朝时期被迫改奉格鲁派，赐名广法寺，乾隆皇帝赐书“正教恒宣”御匾，从北京雍和宫派出堪布主持寺务，更选十三任后，由拉萨三大寺每三年轮流派出。这所寺院有密宗院，按照上下密院做法，主讲集密、大威德、胜乐等类法，参修僧人逐年增多，获得成就者不少。小金川的八角喇嘛寺(初名索南僧格扎西曲林，后更名达结林)也是一座规模宏伟的寺院，始建于1780年，显密兼授。
在四川甘孜藏区，最早由宗喀巴的嫡传弟子桑结贝桑、噶宇哇·仁青巴、噶居南喀桑波和江玛尔等人分别修建了吉觉贤珠达结德庆、宗拉、帕尔哇仁青岗、蔡木贡等寺。继后又有哲蚌寺创建者扎西贝丹的嫡传弟子扎西僧格和下密院僧人顿珠扎西分别建造噶浦寺和拉托寺，仿效下密院，主传集密类法。
理塘寺，又译长青春科尔寺(弥勒*轮寺)，是在苯教寺庙邦根寺的基础上发展起来的一所格鲁派寺院，明朝万历年间，第三世达赖喇嘛索南嘉措前往青海传教返藏途经理塘时，将其改宗格鲁派，更改名称，成为格鲁派在康区的第一座大寺。该寺设有密宗学院，举行各种仪式，传讲《集密根本续》和《集密四家合疏》等，属于下密院系统。喇绒密宗院是由喜饶多杰修建的，属下密院系统，除了主讲《集密根本续》和《集密四家合疏》外，兼修其他密典。另外，擦瓦佐岗桑阿林和邦达桑阿德庆寺也是密教道场，宗属下密院。
着名的甘孜扎西达结诺布林寺(简称甘孜寺)是1662年由霍尔法王阿旺平措创建的，被称为霍尔十三大寺之一。内设法相学院、南杰扎仓和密宗学院。其中的密宗学院是由阿旺平措亲自建造的，最初他从下密院带来几名僧人讲授胜乐、集密、金刚大威德法，定期举行护法酬补法会，⑴参加修行的僧人很多。
噶丹松赞林寺是云南迪庆藏区的第一所格鲁派寺院。1679年和硕特部蒙古兵抵建塘，随来的四十名格鲁派僧人念经诵咒，摄徒修法，修建了这所寺院，不久改宗了当地一批噶举派寺院。从此以缘起性空为理论，以实修生圆二次第教授为主的格鲁派教法在云南藏区扎根，并逐渐发扬光大。
青海是宗喀巴的故乡，格鲁派创立初期，大慈法王释迦益希进京途经青海，停留今民和县，还藏时在这里建弘化寺。后来，宗喀巴的又一位弟子香喇嘛带着宗喀巴的画像和一些遗物回青海建喀的喀寺，传讲格鲁派教法。1402年，宗喀巴的弟子在今循化建贡钦扎西曲科林寺。三世达赖索南嘉措在青海会晤俺答汗期间新建了仰华寺，扩建塔尔寺，将隆务寺、瞿昙寺改宗格鲁派。四世达赖进藏时，又建佑宁寺等。塔尔寺、佑宁寺、广惠寺、东科尔寺、隆务寺、夏琼寺、却藏寺、同德的石藏寺、拉毛德庆寺、拉加寺等大型寺院都设有密宗学院，创建者多为留学西藏的高僧，前后在哲蚌、色拉和上下密院学法，精通显密教法，建寺过程中得到了达赖和班禅的关心。这些密宗学院所学的密典都是上下密院的通用教材。
明朝中后期，随着第三世达赖喇嘛索南嘉措的东行传教，格鲁派教法传入甘肃藏区，很多原建寺院纷纷改宗，格鲁派一跃占据统治地位。1459年，钦隆布从西藏学成归来，改卓尼寺为格鲁派寺院；1729年，阿旺程勒建居巴扎仓(密宗学院)，开设八个班级，生起次第设四个班，圆满次第设两个班，“主要学习密宗基本知识及声韵、绘制彩粉坛城方法等，三年后考试，合格者可升入上下“知尕”班学习”。⑵学完八个班级的全部课程，通过考试授予“俄仁巴”学位。天堂寺曾奉萨迦和噶举派，后来改宗格鲁派，设显密两大学院，“尤重密宗，并以无上瑜伽密为最高修行次第”。
在新建寺院中，夏河拉卜楞寺规模最宏伟，被称为格鲁派在藏区的六大寺院之一，其创建人是五世达赖喇嘛的弟子第一世嘉木央活佛。初建时设闻思学院和续部下院，第二世嘉木央活佛时期，增设时轮学院，1878年建成喜金刚学院；1941年，又建续部上院。续部下院设三个班级，初级班学修生起次第法，中级班学习各种仪轨，高级班修炼生圆二次第法，每年农历二月通过密宗答辩，取得俄仁巴学位。续部上院是按照拉萨上密院修建的，班级和所学经典都与上院相同。喜金刚和时轮两大学院也属密宗系统，喜金刚学院主要学修以《喜金刚根本续》为主的喜金刚类法，分三个班级，分别学习经典背诵、各种仪轨和禅坐静修。时轮学院主修时轮类密法，包括《时轮根本略续》、《时轮根本续无垢广疏》及其时轮历算等。
1760年，由第二世嘉木央活佛主持建造的噶丹曲科林(阿木却乎寺)设密宗学院。1748年，由第五十三任甘丹赤巴萨木察坚参僧格所建的噶丹贤珠贝噶卓巴林(朗木寺)设喜金刚和时轮学院。其他如噶丹扎西桑珠林、叶尔巴贡桑珠林和妙因寺等也设有密宗学院。
⑴ 护法酬补，亦称酬补护法。护法，即护法神。藏传佛教许多寺院每年举行盛大法会，用一种特制的食品供养护法神，诵经祈祷，故名。
⑵《甘肃藏传佛教寺院》，蒲文成主编，青海人民出版社，1990年，第532页。
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