..續本文上一頁來藏，一切衆生悉有佛性，即是我義。如是我義從本以來常爲無量煩惱所覆，是故衆生不能得見29。
衆生具有佛性，只是被煩惱所覆，不得顯現，就如貧女寶藏、烈士額珠，本自具足。《涅槃經》的思想，反映了衆生只有一性，就是都有佛性，都能成佛。
五性各別，無性有情不能成佛，是奘公所譯瑜伽唯識經論的特色。瑜伽一系經論把一切有情分爲五種性：一、菩薩種性，二、緣覺種性，叁、聲聞種性，四、不定種性，五、無種性。其中，無性有情及趣寂聲聞不能成佛。本經《無自性相品》說：
非于一切有情界中，無有種種有情種性，或鈍根性、或中根性、或利根性有情差別。善男子！若一向趣寂聲聞種性補特伽羅，雖蒙諸佛施設種種勇猛加行，方便化導，終不能令坐道場證得阿耨多羅叁藐叁菩提。何以故？由彼本來惟有下劣種性故。一向慈悲薄弱故，一向怖畏衆苦故。
《解深密經》提出有情種性差別，並說明趣寂聲聞不能成佛，但還沒有說到五性名目。唯識宗另一依據經典，魏譯《入楞伽經·集一切佛法品》說：
複次，大慧！我說五種乘性證法。何等爲五：一者聲聞乘性證法，二者辟支佛乘性證法，叁者如來乘性證法，四不定乘性證法，五者無性證法30。
這是五性的明證，顯示有情根機不同，有五種差別。
繼承種性思想的，還有《瑜伽師地論》。該論在聲聞地、緣覺地、菩薩地中建立叁乘行果時，都強調種性的重要。如《瑜伽師地論·菩薩地》說：
雲何種性？謂略有二種：一本性住種性，二習所成種性。本性住種性者，謂諸菩薩六處殊勝，有如是相，從無始世展轉傳來，法爾所得，是名本性住種性。習所成種性者，謂先串習善根所得，是名習所成種性31。
種性又叫種子，或曰界。種性有二：一是本性住種性，無始以來法爾而有；一是習所成種性，後天熏習而成。種性的作用，如該論《菩薩地》說：
以諸菩薩自乘種性，爲所依止故，爲建立故，有所堪任，有大勢力，能證無上正等菩提，是故說彼自乘種性，爲諸菩薩堪任性持……住無種性補特伽羅，無種性故，雖有發心，及行加行，爲所依止，定不堪任圓滿無上正等菩提32。
《瑜伽》在聲聞地中說到聲聞行果時，也強調聲聞種性的作用，以爲叁乘行果的建立，必須有叁乘種性爲因。假如叁乘行者不具有種性，即使修行也是枉然。
自《深密》、《瑜伽》提出五性各別說後，經十大論師提倡，並爲中國唯識宗所繼承。傳說玄奘大師將唯識教授慈恩時，即告之曰：五性宗法，唯汝流通。慈恩果不負師托，力弘五性說。《觀心覺夢鈔》說：
若爾者，有無二性，俱聖所說，更有何故，乍許有性，不許無性？叁乘衆生，皆乘所被，更有何由，乍許大乘定性，不許二乘定性？此等教理，皆如磐石，誰人得動。若以《法華》等皆成說，爲其證者，我以《深密》等五性說爲其誠證。若以《法華》開叁顯一爲其由者，我以《深密》會一立五爲其所由。若以《法華》說相嚴重，爲超過余教之德者，《深密》華藏世界所說，教主即是盧舍那佛，正機即是觀音、彌勒等，諸八地以上大士，一部五卷正宗七品，文文悉盡性相奧府，品品自稱究竟了義，在于十八圓滿報土，說了義教，是何爲耶？對于至極深位大士演淺近門，亦何用耶？何況《法華》雖會叁乘，未會五性，《深密》分明和會一乘，《法華》未說大乘性相，《深密》說回向菩薩，聲聞成佛，兩教隱顯，思可知之。
一性成佛依《涅槃》、《法華》立論，爲叁論、天臺、華嚴諸宗所主張，代表傳統的佛教思想，在中國有廣泛的影響。五性各別的觀點與一性成佛的思想正相反，很難在當時教界立足，故祖師不厭其煩地進行說明。
兩個體系的思想本就不同，我們今天學習唯識，沒必要去會合它們。佛陀對機設教，教法豈能一概而論。學者根據任何一門修行，都能成就佛果。倘若對教法進行比較，在是非上下功夫，不但無功，反而有過。
十一、叁時判教
判教，是對佛陀一代教法按其前後次第所作的分判。在漢傳佛教幾大宗派中，都有各自的判教，且所見各異。如天臺判五時八教，賢首判五教，叁論宗辨叁種*輪。至于唯識宗，則依本經建立叁時判教。
叁時判教的提出，是勝義生菩薩聽聞佛陀顯了說明一切法無性(叁無性)的道理後，回憶如來一生所說的言教，作了義、不了義的區分。《無自性相品》說：
爾時勝義生菩薩復白佛言：世尊初于一時在婆羅痆斯仙人墮處施鹿林中，唯爲發趣聲聞乘者，以四谛相轉正*輪，雖是甚奇甚爲希有，一切世間諸天人等先無有能如法轉者，而于彼時所轉*輪有上有容，是未了義，是諸诤論安足處所。世尊在昔第二時中，唯爲發趣修大乘者，依一切法皆無自性，無生無滅，本來寂靜，自性涅槃，以隱密相，轉正*輪，雖更甚奇甚爲希有，而于彼時所轉*輪亦是有上有所容受，猶未了義，是諸诤論安足處所。世尊于今第叁時中，普爲發趣一切乘者，依一切法皆無自性，無生無滅，本來寂靜，自性涅槃，無自性性，以顯了相，轉正*輪，第一甚奇，最爲希有，于今世尊所轉*輪無上無容，是真了義，非諸诤論安足處所。
叁時教理的區別，就是隱密與顯了、了義與不了義的不同。在如來一代時教中，初時阿含偏說有，隱去遍計所執的空無；第二時般若教偏說空，隱去依他、圓成之有；唯第叁時具顯空有，說叁性、叁無性。因此，第叁時爲顯了說，而前二時是隱密說。
又了不了義者，叁時中前二爲不了，第叁時爲了義。因爲初轉*輪隱空說有，二轉*輪隱有說空，是爲不了。叁轉*輪顯示了空有中道，是爲了義。這種了不了義的分別，是根據教法顯理的全面與否，並非說叁時教理有淺有深。
十二、瑜伽止觀
從學習唯識理論到證得諸法唯識之理，有一個必要過程，就是修習瑜伽止觀。
如何修習止觀？佛陀告訴慈氏菩薩，首先要發菩提大願，然後依十二分教，本經《分別瑜伽品》說：
(十二分教)菩薩于此善聽善受，言善通利，意善尋思，見善通達。即于如所善思惟法獨處空閑，作意思惟，複即于此能思惟心，內心相續，作意思惟，如是正行多安住故，起身輕安及心輕安，是名奢摩他。
菩薩聽聞了十二分教，到寂靜處，專心一意，如理思維，相續不斷，起身心輕安是名爲止。經中又說：
如是菩薩能求奢摩他，彼由獲得身心輕安爲所依故。即于如所善思惟法內叁摩地所行影像，觀察勝解，舍離心相，即于如是叁摩地影像所知義中，能正思擇，最極思擇，周遍尋思，周遍伺察，若忍若樂若慧若見若觀，是名毗缽舍那。
菩薩依教理作意思維，製心一處，獲得了止。同時，又對叁摩地所緣境界進行觀察抉擇，則名爲觀。
止觀種類很多，從對所緣境深淺觀察不同，建立叁觀。即于叁摩地中所緣似法、似義之相分境，生起觀察，爲有相觀；爲善解了此觀境故起思量推察，是尋求觀；于此觀察解了已，如實緣之，爲伺察觀。依此叁觀，施設叁止。因衆生根機不同，止觀所獲處所各異。從十二分教的學習，依其義理修行，爲依法止觀；從某善知識教誡教授修行，爲不依法止觀。又對十二分教總緣、別緣的不同，建立總別止觀。緣個別契經或契經中個別含義修行止觀，是緣別法止觀；總緣一切法或緣諸法總相，作真如解，修行止觀，是緣總法止觀。又根據分別教法粗細有無，建立叁種止觀。于法相粗顯分別領受，是有尋有伺止觀；微細憶念教法，領受觀察所有止觀，是無尋唯伺；于諸法相都無領受觀察，是無尋無伺止觀。
止觀所緣境事有四種：一者有分別影像所緣境事，是觀的境界，可以分別抉擇。二者無分別影像所緣境界，是止的境界，令心專注一處，不起分別。叁者事邊際所緣境界，有盡所有性和如所有性，盡所有性從外延觀察諸法，如緣五蘊等，如所有性從內涵實質觀察諸法，如緣七真如等。四者所作成辦所緣境事，是修行成就時所緣境界。四種所緣在修行過程中，前二種通地前，進入地上則有叁種，成就佛果後，四種都能具備。
修習止觀是依止十二分教，所以修止觀者必須知法知義。經中辨說了五相知法、十相知義、五相知義、四相知義、叁相知義及叁慧知義差別，幾乎概括一代時教義理。值得注意的是，修行止觀者不僅要掌握教理，還應在修習過程中逐漸遣除，由真如作意除遣法相及義相。又修空觀，依十七種空除去難遣之相，如是心境俱泯，能所雙亡，方能見道。
修行止觀的過程中，主要障礙有五系、五蓋、五種散亂及地上十一障。五系，一、顧戀身，二、顧戀財，叁、于諸聖教不得隨欲，四、樂相雜住，五、于少喜足。前二障止，第叁障觀，後二俱障。五蓋，一、貪欲蓋，二、嗔恚蓋，叁、昏沈睡眠蓋，四、掉舉惡作蓋，五、疑蓋。掉舉惡作是奢摩他障，昏沈、睡眠、疑是毗缽舍那障，貪欲、嗔恚是俱障。五散動，一、作意散動，二、外心散動，叁、內心散動，四、相散動，五、粗重散動。五種散動俱障止觀生起。又，十一障是障十一地。
修行止觀是爲了成就無上菩提，要先學習教理，樹立正知正見，積累資糧，到加行位修真如觀，逐漸除遣諸法粗細相，證入見道。見道後，地上菩薩依以楔出楔之法遣除內相。由遣相故，除去相縛。進而斷粗重縛，如煉金法，淘煉其心，乃至證得無上正等菩提。
十叁、如來法身
依據唯識經論修證，能成就二轉依果，一是斷果，即涅槃；一是智果，即菩提。二果的功德總稱法身，標志著佛果殊勝。
法身又曰法性身，是如來依叁大阿僧祇劫修行所成。本經《如來成所作事品》說：
若于諸地波羅蜜多，善修出離，轉依成滿，是名如來法身之相。當知此相二因緣故不可思議，無戲論故，無所爲故，而諸衆生計著戲論有所爲故。世尊，聲聞獨覺所得轉依名法身不？…
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