..續本文上一頁生起，此即阿賴耶識，住于瞋之體性中。”
是故如來藏便恰與阿賴耶相對，而非與“阿賴耶識” 相對。上來所說衆生界叁種法，須加表列，始易說明。
本始基：
如來藏→如來藏本際相應體→清淨法
阿賴耶→阿賴耶識→不清淨法
此中“阿賴耶識”，即“如來藏本際不相應體”。而“如來藏本際相應體”，則可方便說爲佛的心識(智)，唯因不能說佛具有心識，亦不能用“智”表明生起，故始名之爲“如來藏本際相應體”。
由表可知，《不增不減經》所說衆生界叁種法，第一種非指如來藏，乃指“如來藏本際相應體”及其所生一切清淨明相；第二種則指阿賴耶識及其所生一切不清淨明相。前者即遍輪涅顯現、後者即輪回界顯現。
至于第叁種，說爲“如來藏未來際”，此始爲衆生經修道而于“未來際”所證的如來藏，既證已，即住平等性中，故說爲“平等、恒、及有法”。
甯瑪派中是立“心性”、“法性”、“平等性”叁次第，後文將說及。
《勝鬘》複雲——
世尊，然有煩惱、有煩惱染心。
煩惱即指阿賴耶，煩惱染心即阿賴耶識。至于本始基，則如《寶雲經》卷叁所雲——
除蓋障菩薩白佛言：世尊，雲何名爲如實。佛即答言：此法唯可心知，難以口說，非是文字所能宣釋。
除蓋障菩薩白佛言：世尊，雲何法相離于文字。佛答言：言語道斷，出過一切心所行處；離諸戲論，無造無作，亦無彼此；非籌量計較之所能及；亦非相貌；過于一切凡愚所見；出過魔界；出過一切結使處所；出過一切心意識表；不住寂滅賢聖處所；而諸賢聖之所證知。善男子，具此十事，是則名爲究竟如實，是一切智所說不思議境界、不二境界。
此中所說十事，即超越(出過)輪回涅槃二界一切明相，是則名爲如實，此即本始基的義理，所謂含容一切法而不著一切法，爲離于文字的法相。
于《法句譬喻經》中，即有關于修習超越阿賴耶及其自顯現的開示。
經言：有一少年比丘淫欲熾盛，難于自製，及欲持斧自斷其根，釋迦止之，曰：“卿何愚癡不解道理，欲求道者，先斷其癡，然後製心。心者善惡之根源，欲斷根者先製其心，心定意解然後得道。”于是世尊即說偈曰——
學先斷母 率君二臣
廢諸營從 是上道人
漢譯本這首偈不易解，若依藏本，則可改譯如下——
應先弑父母 滅君及二淨
且滅國與境 斯人自性淨
據敦珠法王開示，偈中的“父母”，指能執與所執(如情欲與執持情欲)；“君”指阿賴耶；“二淨”指崇拜梵天的清淨行，以及執著于苦行、戒律的清淨行；“國與境”即阿賴耶識及余識等八識聚，以及內入之能所。若能超越上述種種，則爲自性清淨。此即以阿賴耶爲君，以阿賴耶識爲國，亦即阿賴耶識之生起，實依阿賴耶。故修證阿賴耶的空性，便須除情意之執，且除人我、法我之執①(崇拜梵天爲我執，執神我不滅故；禁戒行則爲法執，執禁戒故。)，及種種由識與境生起的汙染。
如是即爲對治明相之道。
由于本始基及如來藏均爲凡夫不可思議的境界，是故凡夫修道唯修阿賴耶識，以至證阿賴耶的空性，亦唯由此始能認識如來藏及明相，因此上來所說衆生界叁種法，唯第二種(阿賴耶識及不淨法)對實際修持最爲關切。于證阿賴耶空性後，始進而至證如來藏的空性，以迄圓成“未來際”的平等、恒、有法。
這叁個層次，甯瑪派分別稱爲心性自解脫、法性自解脫、平等性自解脫。故龍青巴尊者便有說此叁種自解脫之叁論。
上來總釋四決定，空性雖爲根本見，唯以修道而言，則須知本始基及明相自顯現的義理，此如星月于大海中顯現，其顯現雖依于大海，但卻實非由大海造作而生起。故本始基雖具輪回涅槃二界明相，而明相實自顯現，非由本始基造作而成。且對本始基而言，亦無輪回涅槃的分別，如大海對星與月實無分別。
如此《寶性論》釋頌雲——
如空遍一切 而空無分別
自性無垢心 亦遍無分別
故周遍且無分別，如虛空、如大海，即是法爾清淨自性。
叁 離言空性——釋見之一
佛家諸宗無不說空性，唯所空的範圍卻有差別。本論所說爲“離言空性”，以輪回界空，即涅槃界亦空，以至兩界明相所依之本始基亦空，如是空性境界實離言诠，唯佛內自證，故立名相爲離言空性。
此如《文殊師利所說不思議佛境界經》雲——
爾時文殊師利菩薩白佛言：“世尊，如來于何等境界而得菩提？佛言：童子，我于空境界得菩提，諸見平等故：無相境界得菩提，諸相平等故；無願境界得菩提，叁界平等故；無作境界得菩提，諸行平等故。童子，我于無生、無起、無爲境界得菩提，一切有爲平等故。
時文殊師利菩薩複白佛言：世尊，無爲者是何境界？佛言：童子，無爲者非思量境界。
文殊師利菩薩言：世尊，非思量境界者是佛境界，何以故？非思量境界中無有文字。無文字故無所辯說。無所辯說故絕諸言論。絕諸言論者，是佛境界也。
立“離言空性”，謂涅槃界亦空，非是斷見，以其空而法爾能作功德事業，譬如大日，雖空而法爾有光輝與熱力，故說空性非是虛無，此即所謂“名言有”。
如上經雲——
文殊師利菩薩言：世尊，空是有，是故貪瞋癡亦是有。
佛言：童子，空雲何有？貪瞋癡複雲何有？
文殊師利菩薩言：世尊，空以言說故，有貪瞋癡亦以言說故有。
所謂“言說故有”，即名言有。
輪回涅槃兩界明相，皆名言有，此中又分人我與法我。
本論空人我，分叁際以建立見地，即索求初際生起“我”之源頭；尋伺“我”于中際時何所住；尋求後了示“我”所趨之境，如是叁時皆不可得“我”，由是說人我空。
此種尋求，貌似小乘，如中際時尋求“頭”非我、“皮”非我等，尤似小乘之析法空。然分初、中、後際以尋求，實即尋求輪回界明相爲自顯現之理，故已爲體法空的層次。
本論所重爲法我空，層層建立空性決定，此即道次第之所依。此中所包羅之法義廣大，唯識、中觀、如來藏叁系大乘思想皆攝。
說法我空分四——
一尋伺明相所緣之基。由此出“本始基”及“明相”的義理。此中說“明相”如何于空性中生起，成爲緣起，是爲重點。
二遮撥一切法似實有。此中指示無爲虛空，指示有爲法如何爲實性空，是爲重點。
叁說辨難利害爲過失。由此說本尊與魔障(善與惡)之利害執著，實爲迷亂，如是明平等性，是爲重點。
四破希疑。此中希求涅槃與疑懼輪回皆爲所破，由是知內自顯現深義，是爲重點。
本論體例，爲論主在夢中或定中與祖師、菩薩、佛對話。說法義訖，聖者每謂如是如是即可成何種瑜伽士，此法義及稱謂，即明示次第。
今人將“瑜伽行”等同唯識學派，實只是方便的說法，實際上，“瑜伽”(Yoga)爲“相應”義，凡與見地相應的修行皆稱爲瑜伽。因此唯識學派可包括于“瑜伽行”之內，而不能說“瑜伽行派”即唯識學派。由是“中觀瑜伽行”，即指持中觀見修止觀的行人，並非將中觀與唯識調和建立一理論，而安立此名。換而言之，“瑜伽行”通指心識修習，而“中觀瑜伽行”則唯指持中觀見以作修持的行人。
修瑜伽行的行人，稱瑜伽士(Yogin)。此中所謂“幻化瑜伽士”、“虛空瑜伽士”等，即謂其能與“明相爲幻化”、“虛空七金剛喻”等見地相應，非謂有特別法門可修成幻化瑜伽士、虛空瑜伽士。亦即謂，由任何法門修習皆與名相無關，所關者只是其修習而得相應的見地。
此如《瑜伽師地論》卷叁十八所雲——
雲何菩薩法隨法行……一者奢摩他；二者毗缽舍那；叁者修習奢摩他毗缽舍那；四者樂修奢摩他毗缽舍那。
此“法隨法行”即修止、觀、止觀雙修、止觀雙運，攝無量勝叁摩地，是故凡修止觀皆可稱“瑜伽行”，而不限于唯識也。若如今人，但以“瑜伽行”專指唯識學派，則將不明本論于各次第立“瑜伽士”之名，實爲次第見修配合。
今說“尋伺明相所緣之基”。
此見地，爲法我空四見的基礎。明相所緣之基，即是“名相”，所謂“名相”，即是以標簽加于非實有之明相上。由是知一切法皆空，所具者無非假名。此即《金剛經》之叁句義：“甲、非甲、是名爲甲”。
須知此“叁句義”爲同時，非先肯定，再加以否定。即于肯定其假名之同時，已否定其本質。
複次，須知緣起。即唯具假名之事相以何因緣而得顯現爲明相。
本論指示，以本始基爲因，以執我之識爲緣，如是因緣和合，一切明相即如幻顯現。
此如《解深密經·如來成所作事品第八》雲——
當知化身相有生起，法身之相無有生起。
又雲——
曼殊室利菩薩，若于是處，我以十一種相，決了分別顯示諸法，是名本母。何等名爲十一種相。一者世俗相；二者勝義相；叁者菩提分法所緣相；四者行相；五者自性相；六者彼果相；七者彼領受開示相；八者彼障礙法相；九者彼隨順法相；十者彼過患相；十一者彼勝利相。
此十一種相，已攝清淨汙染一切法相，輪回涅槃以及修行道上種種相悉包括無余。複雲——
佛告曼殊室利菩薩曰：善男子，汝今谛聽，吾當爲汝略說不共陀羅尼義：善男子，若雜染法、若清淨法，我說一切皆無作用，亦都無有補特伽羅。以“一切種”離所爲，故非雜染法；先染後淨非清淨法。
後淨先染凡夫異生，于粗重身執著諸法，補特伽羅自性差別，隨眠妄見以爲緣故，計我、我所，由此妄見，謂我見我聞我嗅我嘗我觸我知；我食我作我染我淨，如是等類邪加行轉。
此即說以執我之識爲緣，緣生一切顯現。
故欲了知明相所緣之基，須知二事。一者假名施設；二者明相顯現之因緣。此已如前說。
次者說“遮撥一切法似實有”。
此謂空性之虛空，爲生起一切情器世間之基，如月影以水爲基。
空性虛空具七金剛功德——無瑕、無壞、無虛、無染、無動、無礙、無能勝。
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