..續本文上一頁識依見愛煩惱增長”。實則不但意識依煩惱增長，五意也因微細的煩惱而增長。心意識，都是雜染的，虛妄分別爲性的。從虛妄分別所起識，即與染惑根本的無明不離。必須斷盡妄心的無明，淨智的真心，才可以顯現，才名爲轉識成智。這一科，應與上文連合去了解。
這說明緣起甚深；攝大乘論也有說明緣起甚深處，然與本論極不相同。無明，根本的微細的，是阿賴耶識中的不覺分。意識，依見愛煩惱而增長；依心起意──五種意是依無明不覺而生起。熏習，是給與力量；由無明妄動力所引的識，名“依無明熏習所起識”。今約此差別義說；若約無明妄染的貫徹始終說，凡依根本無明熏習所起的，不但五意，分別事識也是無明熏習所起的。然無明熏生的意識境界，二乘是能斷能知的。今依無明(直接)所生起的微細妄識，即依心所起意，所以“非凡夫能知”，也“非二乘”的“智慧所覺”。聲聞、緣覺志在了生死得解脫，不求一切種智，所以不知根本。菩薩求一切種智，一切種智以徹了一切法爲境，所以唯有“依菩薩”行者，“從”最“初”于大乘起“正信”時起，即“發心觀察”無明熏習所生識。正信心未成就以前，名十信；既成就正信，即進入初發心住。初入正信發心住的菩薩，于無明所起的微細妄識，即能起觀察：或從意識的比觀類推而得；或依經論中所說的觀察而知。雖起類似的了知，但還不能真知。“若”登初地以上菩薩，能“證法身”，這才能“得少分知”。少分知，即證知一分。這樣的分分了知，一直到“菩薩究竟地”──第十法雲地：也還“不能盡知”。“唯”有成了“佛”，才能徹始徹終的“窮”盡明“了”。所以法華經說：“唯佛與佛，乃能究盡諸法實相”。涅槃經也說：“菩薩見終不見始，佛見終亦見始”。有一分無明，即有一分不能了解；離一分無明，即得一分智慧。到成佛，一切煩惱盡離，真智全顯。才能徹了依無明熏習而起的底裏。無明爲緣而起的，是這樣的甚深！
乙 廣顯緣起生滅
1 無明由起
是心從本已來，自性清淨而有無明，爲無明所染，有其染心，雖有染心而常恒不變，是故此義唯佛能知。所謂心性常無念故，名爲不變，以不達一法界故，心不相應，忽然念起，名爲無明。
緣起的根元爲無明，無明是怎樣染汙自心，這裏給予解說。這是引用勝鬘經說。“是”衆生“心”，“從本已來”，是“自性清淨”的。然而自性清淨，“而”從本以來，又“有無明”。自性清淨心與無明俱，所以自性清淨心“爲無明所染，有”“染心”的妄起。自性清淨心，即覺；無明即不覺。衆生無始以來有阿賴耶識，即無始來是不生不滅(淨)與生滅(染)的和合統一。此和合識中的根本無明，也無始來成就，所以不能說從真心生妄心。自性清淨心，爲無明所染而現爲染心，染心即業識等。“雖”無始來即“有染心”，“而”自性清淨心，還是“常恒不變”，照樣的清淨。“故此”“不染而染，染而不染”的心識緣起“義”，“唯佛能知”，不是凡夫二乘所能了解的。如楞伽經說：“我于勝鬘經中，爲利根人曾說此義”。這自性清淨而有染心，有染心而自性常恒清淨，古德以火燒虛空爲喻。虛空本來是沒有熱性的，由于火燒，虛空也是熱的。實則，虛空還是沒有熱相的。虛空經火燒而似有熱相，喻自性清淨心爲無明所染而有染心；虛空似有熱相而自性不熱，喻自性清淨心雖現有染心而自性仍爲清淨。唯識家但承認真實不變，所以與本論的思想有差別。這即是賢首家所說的：“不變隨緣，隨緣不變”義。唯一淨心而不妨有染相的差別，所以覺與不覺，有著矛盾而統一，統一中有矛盾的意義。這是難理解的，唯佛能知。從佛現證而方便安立，即無始來有此相關而又相對的二元。一、“心性”：是“常無念”的，所以“名爲不變”，是常是恒。無念，即沒有妄心所起的名言相──概念。法性，都是離言絕相的。衆生心的當體，也是自性清淨而無念的，染也好，淨也好，起也好，滅也好，而衆生的心性，總是沒有變易的；無念而不曾障礙有念的。二、無明：心性雖本來離言絕相，而衆生從無始來，“不”能如實通“達一法界”。衆生“心不”能與法界“相應”，而“忽然”有“念”現“起”，這即“名爲無明”。心所以不與一法界相應，即由于妄念現前；由于妄念現前，所以不與法界相應；迷真起妄，本是同一內容的分別解說。所以說忽然，不是無緣無故的突然生起，是形容衆生于不知不覺間的任運生起。也因爲，心性是常恒不變的；所以說念起爲忽然，其實是無始來成就的。不了一法界相而起妄念，即名爲無明；無明也即念的別名。
這裏順便一論煩惱：上來說到見愛二煩惱，但見與愛煩惱中，還有二類：一、起煩惱，二、隨眠煩惱。起煩惱，即心生起時，有煩惱與心同時現起。心起的時候，有的煩惱並沒有生起，但不是斷盡沒有了，不過沒有成爲現行，煩惱還是潛在的。這沒有生起現行的潛在煩惱(或名煩惱種子)，名爲隨眠。現起與隨眠的二煩惱，聲聞和緣覺，都是要斷盡的。但煩惱(起、隨眠)以外，還有習氣，這是不障礙二乘得解脫的。如經律中說：阿羅漢有習氣，過去如欲心重的，證得阿羅漢，爲人說法時，還是先望望聽衆中的女人。大乘所明的煩惱，即從此義開合而成。有些大乘經，將隨眠與習氣統一了。見、愛、無明，阿含經常是連在一起說的。大乘經即分別見、愛(叁)、無明爲五住煩惱。住地，即是習氣──習地的意思。見道所斷煩惱，即一、見一處住地。修道所斷煩惱，約叁界爲叁：即二、欲愛住地，叁、色愛住地，四、無色愛住地。這見、修所斷的二類四煩惱，二乘是可以斷的。第五名無明住地。無明也有起與習(實等于隨眠)二類；如無明起，名爲過恒沙上上煩惱。天臺宗分煩惱爲叁大類：見思·塵沙、無明。然依勝鬘、仁王、璎珞等經，前四煩惱，有起有住；無明也有起有住。無明的起煩惱，即是塵沙煩惱。這裏所說的無明，即是無始無明住地，是煩惱中最極微細的，是一切煩惱的根源。本論說此爲二：相應的，不相應的。無始無明住地，是不相應的。勝鬘經的本義，凡是現起的煩惱，即名爲心相應；凡隨眠潛在的習氣(住地)，沒有現起于六識中的，名爲不相應。而本論引用勝鬘經，所說卻不取種現義。依心起意的(叁細意)微細妄心，名爲不相應染。依意的後二及意識中，名爲相應染。本論不從種子現行立說，約煩惱與微細妄心，雖可分別而渾融如一，所以名不相應。如依心取境而生分別，心境分離而于心上起念(心所有法)分別；妄心與染汙心所，明顯的差別，而同時同緣，共作一事，即名爲相應。到意識，相應的意義更爲明顯。本論說煩惱染心，明相應不相應，與唯識學的種現說不同，也與勝鬘經說不合。
2 染心(生起)還滅
染心者有六種。雲何爲六？
無明與染心是有分別的。無明，約不了一法界的根本不覺說；“染心”是依無明而起的，共“有六種”。這裏的無明與六種染心，和上面的心、意、意識；叁細、六粗，都是同一的。不過，約緣起的惑業苦，說爲叁細六租。約心識的次第開展，說爲心、(五)意、意識。約惑障，說爲無明與染心。
一者執相應染，依二乘解脫，及信相應地遠離故。
從無明所起的六染心，從粗到細來說。“一者，執相應染”：意識相應染；即六粗相中的執取相，計名字相。意識與見愛煩惱的染心俱起，外取計著，所以名執相應染。約二乘說，此“依二乘”的“解脫”，得無學解脫時，能遠離斷盡。約大乘說，登初發心住的“信相應地”，即能“遠離”。二乘所勤于斷除的，初住菩薩即可斷除；所以華嚴經中，初住也說爲悟不由他。真谛傳說十解能斷我執，也與此相合。
二者不斷相應染，依信相應地修學方便，漸漸能舍，得淨心地究竟離故。
“二者，不斷相應染”：這是與相續識相應的煩惱，也是六粗的相續相。相續識的煩惱，二乘是不能舍的。大乘“依”初住──“信相應地”──起，“修學”六度、四攝、止觀等“方便，漸漸”地“能舍”此不斷相應染。一直到“得淨心地”，即初歡喜地菩薩，才能“究竟”的舍“離”。淨心，聲聞即見道時的四證淨。菩薩是初地時的證見真如。此時，清淨的信解心，能舍離不斷相應染。二乘所斷的分別俱生二種我執，菩薩在初住時已經斷除；而二乘所不斷的，屬于分別的法執，菩薩于十住中漸舍，到淨心地時能究竟離。初地證見法空，證知如來藏性，即可遠離此不斷相應染。
叁者分別智相應染，依具戒地漸離，乃至無相方便地究竟離故。
“叁者，分別智相應染”：是智識相應的煩惱，也是六粗中的智相。智識，對境生心而起分別，分別染淨；與分別心相應的煩惱，即名分別智相應染。這要“依具戒地漸離”。具戒地，即第二離垢地；二地戒波羅密多圓滿，所以特名具戒地。從二地起，能漸離此分別智相應染；一直到“無相方便地”，才能“究竟”遠“離”。無相方便地，即第七遠行地，七地以前爲有相地，還不能一向顯示無相真實。第七地能純無相觀而還有功用；有功用，即是要假方便而起無相觀。第八地才不假功用而入無相。無相，體證離言法性而不爲法相所惑亂；七地雖有功用而能現觀無相，所以名無相方便地。到此，分別智相應染，能究竟遠離。
四者現色不相應染，依色自在地能離故。
“現色不相應染”，即雜染的現識，也是六相中的境界相。現識能現一切境界，如淨明鏡的現衆色相，所以說現色。現識，不是心境相待，而是內心任運能現一切境相；微細的現識心境，沒有心心所差別，所以名不相應。現識所有的煩惱，即名現識不相應染。此“依色自在地能離”。色自在地，即第八不動地。八地以前，不能于境得自在。第八地菩薩，能從無相無功用心，起如幻叁摩地；從如幻叁摩地中，能自在顯現色法，如虹霓的幻現。這樣的于色得自在，所以能任運的現無量…
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