..續本文上一頁的國土(依報)及其名號(正報)，現在要分別陳述藥師如來的行願。此科文長，又分叁節，先總說。
佛呼「曼殊室利」說：「彼」東方淨琉璃世界的「世尊，藥師琉璃光如來」，他所以證得圓滿佛果，成就清淨莊嚴的世界，即因過去生中，「本行菩薩道時」，以大悲心，「發十二大願」，攝導衆生。藥師佛因地所發的大願，不同凡夫的爲了滿足自我的欲求，也不像小乘的只顧自了生死，獨善其身；自是慈悲心懷的流露，爲了滿足衆生的願欲。所以這裏說，藥師如來的本行大願，是爲了「令諸有情」的「所」有希「求，皆」能獲「得」。如希求離生死苦，成菩提樂；或求往生淨土；或有病患而要求全愈；或因其它種種人生缺陷而要求彌補。如此各式各樣的欲求，藥師如來從他的大功德，慈悲善巧中，能隨衆生心所欲者，皆得滿足。
因地發十二大願，是願力；令一切有情所求皆得，則是成佛以後，本願功德的完滿實現。佛在因地發了大願，並非一切留到成佛以後，而是照願心 [P51] 去實踐，去求充實，這樣，惑業漸漸蠲除，功德一天天增長，到了成佛，才究竟圓滿。藥師佛成大菩提時，十二廣大悲願，都能一一如期實現，就因他在菩薩因地中，對自己所發的誓願，能隨分隨力，躬行實踐，一步步地做去，一點點地聚積，所以他一登大覺地，一切大願也就宣告完成了。藥師是如此，彌陀等也莫不如此。我們依願去求，確能如願感應，這必有其感應的力量存在。偈說：『福慧資糧力，諸佛加持力，及與法界力』。願求之所以能獲成就，實有這叁種力量。1自力，即自身方面，要集有福報及智慧的資糧，特別是信願真切。如醫生給你治眼疾，要眼有複明的機能；如眼睛真的壞了，再高明的醫生，也無能爲力。2佛的加被力，佛菩薩的悲願，永遠顧念著衆生，光照著衆生，祗要衆生的希求，是合理而有可能的，便都可以交感。3法界力，一切法的本性──法界本無差別，無限礙的平等法界中，生佛平等，凡聖一致。所以衆生有感佛可能性，諸佛菩薩有隨感而應的可能。這樣，我們若能一面依自己的福慧力，一面仗佛願力的加被，那麼，我們要求 [P52] 消災免難，離苦得樂，必定可以成辦。
己二 別敘
庚一 生佛平等願 『第一大願：願我來世得阿耨多羅叁藐叁菩提時，自身光明，熾然照耀無量無數無邊世界，以叁十二大丈夫相，八十隨形好，莊嚴其身；令一切有情，如我無異。
此下即將十二大願，逐一分別敘說。
釋尊對曼殊菩薩說：藥師如來在因地所發的十二大願中，「第一大願」 ，是生佛平等願。他立「願」說：「我來世」證「得阿耨多羅叁藐叁菩提」的「時」候，「自身」能放射大「光明」，「熾然照耀無量無數無邊世界」。叁藐叁菩提，此譯正等覺。正覺通于小乘，等覺通于菩薩，故在叁藐叁菩提之上，又加一阿耨多羅，阿耨多羅譯爲無上。無上正等覺，即佛的圓滿覺；佛的正覺，是最極遍照最極究竟的。平常說：『放下屠刀，立地成佛』， [P53] 成佛好象是很容易的。其實必須福慧資糧具足，自利利他的無邊功德，都達到最高峰，最圓滿的境地，才能成正等覺。修行者，祇是或多或少，成就佛德的一部份而已。藥師說他將來成佛時，要身放光明。光明如火焰一樣，叫熾然；從佛身而遍照一切世界，這是諸佛同具的身相。如佛像後有一光圈，即是(化身)佛陀的圓光相。毗盧遮那佛，就是光明遍照的意思；大日如來，也即以太陽的光照爲喻；大乘經中，常說到佛的光明，照耀無量世界。我們雖生活在這去佛時遙的末世，未見佛陀的真身，但我們仍然沐浴于佛的慈光中，祗是不自覺罷了。如太陽雖懸空朗照，可是瞎子卻見不到。佛光也如此，無時不照，無處不照，衆生因無明煩惱的障蔽，常在光中而不見光。修學佛法的，果能精勤進修，淨除煩惱的塵垢，見佛光明，或是見佛現身，那是必然之事。
藥師如來證大菩提時，又「以叁十二丈夫相」及「八十」種「隨形好，莊嚴其身」。身似琉璃光輝映徹，已顯得藥師如來的身相，是如何地明淨！ [P54] 再加上這叁十二相、八十隨形好等，更見德相的圓滿莊嚴。叁十二相是爲印度公認的大人相，特別爲男子的勝相。這裏不能一一說明，略舉數種來說，如佛足底的平滿相，千輻輪相，佛身的紫金色相，垂手過膝相，頂髻相等，共有叁十二種之多(詳見法數)。這些相，依印度當時的相法，爲最高貴最莊嚴的福德相。輪王或如來，才完滿的具足。八十種隨形好，是隨身體的某部形態，所有某種美的特征，如佛手柔軟，毛發光澤，面容豐滿等。釋尊當時即因德相莊嚴，每次出遊教化，還不曾說法，便有很多人要求歸依。佛法本不著相，但爲了導引衆生，令衆生歡喜生信，所以藥師如來因地中，要發願具足這種福德莊嚴相。藥師佛的本願，不但希望自己身相光明，衆好具足，同時還希望，「令」所有「一切有情」，皆「如」自己一樣，平等平等，「無」有差「異」。這可約兩方面說：1約淨琉璃世界的生佛平等說：生于東方淨土，身相圓滿，與佛無異。但不能說一切有情，因爲現實的衆生界，並不曾真的如此平等。2約一切衆生佛性說：一切衆生性，本都是光明遍照 [P55] ，具叁十二大丈夫相，八十隨形好的。如來藏經說：一切衆生皆有如來藏，光明顯赫；叁十二相，八十隨形好，本來具足。祗因衆生爲無明所覆，不曾開顯，所以隱而不現。這要到成佛，方能如實證知。故華嚴經說：『奇哉！奇哉！一切衆生皆有如來智慧德相，但因妄想執著，未能證得』。在佛的心境，照見一切衆生，確是平等不二的。約這意義說，佛證得無上正等覺時，大地衆生無不是佛，衆生與佛平等平等。但從衆生邊看，衆生苦惱，愚癡暗昧，于一切諸法實相，從來不知不見，痛苦流轉，何能與佛平等？因此，有人說我們是凡夫，不要妄自尊大；盡管生佛平等，而我們還是衆生。有人說：我們要深信自己是佛，如禅宗要人直下承當自心是佛；密宗要人起佛慢，說即身成佛。這些話，可說都有一分道理。我們是凡夫，所以要修行辦道；因爲有成佛的可能性，所以可修行成佛。
庚二 開曉事業願 『第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外明徹，淨無瑕穢，光明廣 [P56] 大，功德巍巍，身善安住，焰網莊嚴，過于日月；幽冥衆生，悉蒙開曉，隨意所趣，作諸事業。
此文與第一大願的意義有關而用意不同。上願重于佛的法性身，顯示生佛平等。此願重在從法性而起應化身，開曉衆生。
藥師如來因地所發的「第二大願」，是說：「願我來世」，究竟證「得」大「菩提時」(菩提，即阿耨多羅叁藐叁菩提的略稱)，「身」相猶「如琉璃」寶，「內外」都極「明」亮瑩「徹」，「淨」潔得沒有絲毫的「瑕」疵和垢「穢」。所有的「光明廣大」，豁破無邊黑暗；如此「功德」莊嚴身，「巍巍」不動如須彌山一樣，所以說：清淨佛「身」，「善」于「安住」。佛身的光明熾盛，光光相照，形成一種「莊嚴」的「焰網」。光明遍照，「過于日月」──日月祗是世間的光明，自然不及佛身的光明。
如來藏經，曾以九喻說明衆生的本有佛性，也有琉璃寶喻。衆生的佛性，如清淨無瑕的琉璃寶，雖藏在汙染中，但它的光澤明淨，依然不損分毫。 [P57] 懂得此理，衆生的佛性身，也如琉璃，盡管流轉生死淤泥中，也不失其原有的光潔。藥師如來，徹底揭去無明暗影，刷除煩惱汙泥，本身佛性身畢竟顯發，故說身如琉璃。
藥師如來的身光，照及「幽冥」的苦惱「衆生」，使其癡暗心眼，「悉蒙開曉」，而能「隨」著各人心「意」的「所」有「趣」求，「作諸事業」去。這段文義，約淺顯說；佛放光時，住在黑暗世界，一向不見光明、不聞佛名的衆生，受到佛的光明照了，就得著開曉，而隨自己的意趣，做他所樂意做的種種事業。這如太陽東升，一切人都從寤而起，作工的作工，讀書的讀書，種田的種田，做生意的做生意，大家各事其所事。然約深密說：衆生無始以來，在愚昧昏迷之中，什麼都不曉得，由于佛的慈悲願力，啓發衆生的智慧，便一樣一樣都明白起來，會做起來。古代厚生利群的發明家，可說都是佛菩薩的化身；佛菩薩在無知的衆生前，每每現身開導，發明房屋、耕種、紡織、文字……；種種器具，種種正當學說，使衆生知道實行。世界文 [P58] 化的進步，各種工巧技術，都發生于佛菩薩的慈悲與智慧之中。所以經說：若無佛菩薩出世，世間一切善法，一切資生具，就都沒有了。故佛菩薩化世，不但開導衆生以身心修養，也開導衆生以一切知識和技能。約這個意義說，我們是無時無處，不在藥師佛的智光遍照中，慈光護持中。
庚叁 無盡資生願 『第叁大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情，皆得無盡所受用物，莫令衆生有所乏少。
一個人生存在世界上，爲了維持生命，必須有足夠的資生物──衣、食、住、行，乃至醫藥。這一切物質生活的受用，不僅要有，而且要多，要豐足，少了就會引生世間的諸般罪惡。譬加盜竊、劫殺、鬥爭……等罪惡的滋長，多因資生物的缺乏。所以藥師如來的悲願，不但要使衆生獲得謀生的知識和作事的能力，而且要「以無量無邊」的「智慧方便」，生産多量的「受用物」資，「令」一切「有情」，凡有「所」需要的，「皆」能「得」受用 [P59] 「無盡」，而給大家過著富足、豐裕、安樂的生活，絕不「令衆生」，對于物質的供應上，「有所乏少」，發生你有我無的現象。
瑜伽師地論說：菩薩學法，當于五明處求。五明，除了佛法──內明，還有工巧明、醫方明、聲明、因明。修學大乘菩薩行，凡有利衆生的學問技能，都要學，智慧一天天求增長，到了成佛，一切功德妙法，始能圓滿具備，取之無…
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