(一)又作秘密壇。總稱一切密教之曼荼羅；此系以曼荼羅來總顯一切密教秘法之故。准此，密教修法中，依各種需要，建立壇場而修諸尊之叁昧耶形，其所立之壇皆可稱秘密曼荼羅。又各種秘密壇中，修護摩法者稱爲護摩壇，供作灌頂者稱爲灌頂壇，作布置曼荼羅者則稱爲曼荼羅壇。

　　(二)指已得瑜伽悉地之深行阿阇梨于定中所現之曼荼羅，即五種叁昧耶中之第五。密教爲根機特優之人授與秘密壇灌頂時無需擇地造壇等之具體行業，而系由瑜伽阿阇梨于定中現出秘密壇，例如以心灌頂、秘密灌頂之壇，又如大日經所說之支分生曼荼羅及秘密漫陀羅品所說之胎藏都會與別壇之曼荼羅等均屬之。［大日經疏卷十四、胎藏界曼荼羅鈔卷上］

　　（術語）總言一切之曼荼羅。以曼荼羅總爲秘密之法也。別之則立壇而行諸尊之叁昧耶形。謂爲秘密曼荼羅。金剛界曼荼羅大鈔一曰：“秘密曼荼羅者，諸尊叁昧耶形何隨意立壇行故。”