第三章
普眼菩萨
前一章是对上根菩萨说没有渐次的如幻三昧法门，本章为钝根菩萨开示渐次的圆觉法门。
于是普眼菩萨在大众中，即从座起，顶礼佛足，右绕三匝，长跪叉手而白佛言：“大悲世尊，愿为此会诸菩萨众，及为末世一切众生演说菩萨修行渐次：云何思惟？云何住持？众生未悟，作何方便普令开悟？
于是普眼菩萨在大众中起座，顶礼佛足，右绕三匝，长跪叉手而对佛说：大悲世尊，愿为此会诸菩萨众，及为末世一切众生演说菩萨修行渐次，如何思惟、住持，以及有什么方便法门？即是如果有刚开始修菩萨道的人，听闻这个圆觉境界，应当怎样思惟观察乃得纯熟？怎样安住受持而不为一切环境转移？如果于此圆觉境界未能开悟的众生，有什么方便法门让他开悟？
世尊，若彼众生无正方便及正思惟，闻佛如来说此三昧，心生迷闷，即于圆觉不能悟入。愿兴慈悲，为我等辈及末世众生假说方便。”作是语已，五体投地，如是三请，终而复始。
如果那些没有善巧方便及正思惟的众生，听闻佛所讲的菩萨修行如幻三昧，即一切幻化本来就是圆觉妙心的显现，“心生迷闷”，心中迷惑不乐听闻，不能够接受幻化就是觉性所显现，因此不能悟入圆觉妙心。希望佛慈悲，为我们以及末世众生解说方便法门。
尔时，世尊告普眼菩萨言：“善哉！善哉！善男子，汝等乃能为诸菩萨及末世众生，问于如来修行渐次，思惟住持，乃至假说种种方便。汝今谛听，当为汝说。”时，普眼菩萨奉教欢喜，及诸大众默然而听。
“假说种种方便”，佛教导众生修行，有些法门是直截了当的方法，有些是转弯抹角的法门，而转弯抹角的法门就是假说种种方便。好像医生为了要让病人吃很苦的药，就放一些甜品进去，加甜品是方便法。佛的种种假说方便，不是佛说法的本意，而是因众生执迷而必须那样的教导，所以佛才随顺执迷者而巧立方便说法。如《法华经》说：“我即自思惟，若但赞佛乘，众生没在苦，不能信是法。破法不信故，坠于三恶道，我宁不说法，疾入于涅槃。寻念过去佛，所行方便力，我今所得道，亦应说三乘。”此经说三乘是假说方便，本来圆觉是究竟。
善男子，彼新学菩萨及末世众生，欲求如来净圆觉心，应当正念，远离诸幻，先依如来奢摩他行，坚持禁戒，安处徒众，宴坐静室。
佛为上根菩萨开示没有次第的如幻三昧，为初发心菩萨以及末世众生种种假说及方便开示有次第的法门；要次第悟入如来清净圆觉妙心，应当依次第生起正念心，一心一意要远离一切幻妄。先依照如来教授的奢摩他行，修定建立正念与清净心。佛教的修行方法有二大种类：一种叫止，一种叫观。止就是奢摩他——修清净心，观就是毗婆舍那——修清净见。这两种修法都能够产生定，即是三摩地。“坚持禁戒”，专心一意把戒律持好。此处是讲新学菩萨有很多贪嗔痴的烦恼，心不定，所以要持戒，先使身的行为清净。“安处徒众”，先安置徒弟、信众与放下一切作务，然后“宴坐静室”，安处静室，结跏趺坐。
恒作是念：我今此身四大和合，所谓：发、毛、爪、齿、皮、肉、筋、骨、髓、脑、垢色，皆归于地；唾、涕、脓、血、津液、涎沫、痰、泪、精气、大小便利，皆归于水；暖气归火；动转归风。四大各离，今者妄身当在何处？即知此身毕竟无体，和合为相，实同幻化。四缘假合，妄有六根；六根、四大中外合成，妄有缘气，于中积聚，似有缘相，假名为心。善男子，此虚妄心，若无六尘，则不能有。四大分解，无尘可得，于中缘尘各归散灭，毕竟无有缘心可见。
此节正答云何思惟。新学菩萨不能直接观如幻，因为他们认取身心实在，所以先观察身，次观察心。
新学菩萨观察身心时，应经常作如是思惟：我今此身四大和合，所谓：发、毛、爪、齿、皮、肉、筋、骨、髓、脑、垢色，皆归于地大；唾、涕、脓、血、津液、涎沫、痰、泪、精气、大小便利，皆归于水大；“暖气归火”，体温归于火大；“动转归风”，呼吸及血气等所有运转归于风大。古希腊及印度人认为世间的一切有形物质，都是由地、水、风、火四种极微物质组成，称为四大。地大性坚硬，水大性潮湿，风大性流动，火大性温暖。任何物质都具有四大的性质，比如冰被解释为是水的地大增多，水汽是水的风大及火大增多，其实就是物质的固态、液态、气态、热能四种性质，被误解为物质的四种基本元素。佛依世俗常识执以为实有的四大来开示佛法，教导观想身体就是由地、水、风、火四大组成。“四大各离，今者妄身当在何处”？观察四大各有所归，究竟这个幻身在哪里？都无实体可指，即知此身毕竟无体，不过四大和合，而有此虚妄的相状，所以说“即知此身毕竟无体，和合为相，实同幻化”。
观察身心从观身实同幻化开始，然后观身心世界都是幻化的。佛在教导渐次的法门时，必定是先观身后观心。比如四念处修法的次第：观身不净、观受是苦、观心无常、观法无我。如此次第是让众生从粗的心念修到细的心念，观身最粗，观受是心，所以观受比观身微细。受苦乐时心游荡外境，因此心不平静；观心时不理外境，心念比受平静微细，所以先观受后观心。当观心观到贪嗔调服时而非常微细时，便有力量观一切法。
四缘假合以下，详明观心。佛入灭后，论师们归纳整理佛所讲的因缘教法而有不同分类；大乘一般只讲讲四缘，小乘论师更说佛有讲二十四种缘。其实只讲四缘就够了，即是因缘、次第缘、所缘缘和增上缘。比如眼睛看东西就有四缘，眼识不能自己独立生起，要靠根、尘接触，眼识才生。识蕴里的过去业有眼识的业缘——因缘；所有的识前一念灭了，后一念才能生，每一念眼识依前一念眼识灭了而次第生起——次第缘；色尘是眼识所知的境界——所缘缘；其他比如身体、神经、眼根等，帮忙眼识生起来的法——增上缘。即四缘生一切法。
“四缘假合，妄有六根”，因为四缘假合而知道，所以是幻化的，六根——眼、耳、鼻、舌、身、意也不是真实的，是暂时性的。“六根、四大中外合成”，六根为内，四大为外。“妄有缘气，于中积聚”中的“气”是指能量，就是指你过去业的力量，积聚于中，“似有缘相，假名为心”，好像有众缘和合成一个相貌被你知道，佛随顺凡夫称它为心，此能量(妄有缘气)就是能知觉与思维的心。以佛法说，我们的心有二：一、是血肉之心；二、能思维与有知觉的心气——能量，它(妄有缘气)执著在我们的身体里作用，而这股能量也可让你感觉是气。当你胡思乱想太多的时候，心的能量就在头上发涨；当你心无妄念的时候，它就降下来在你的心脏；当你在运动、做东西的时候，它就在手脚上运作。对于执取六根境界者，佛教导观六根境界的前因后果，然后进一步见到身心无我。
“此虚妄心，若无六尘，则不能有”，这个虚妄不实的心，如果没有境界——色、声、香、味、触、法(六尘)，就不能有它的作用。即能知的心与所知的境互相依存，如钟声灭了耳识也灭，没有一个不灭的闻性，因为能听闻的一念耳识随着刹那的声尘而生起，耳识是生灭的虚妄心，不像圆觉妙心那样遍满十方。
“四大分解，无尘可得”，如果四大都分解了，则没有六尘可得。所以说“于中缘尘各归散灭，毕竟无有缘心可见”，四大解散了，众缘中的六尘各归散灭，六识是随六尘、六根而生起的一念生灭心，根或尘任何一方灭，则识也跟着灭。有人认为有不灭的闻性，其实能闻是妄心，所闻是妄境，虚妄的心境皆是无常生灭法，所闻的妄境灭了不可能有个能闻的闻性不灭。换句话说，若见声尘有生灭，必定见到心识也生灭，有生灭见故；若见心识也不生不灭，必定见到声尘也不生不灭，无生灭见故。对于执著实有生灭的前因后果等见者，佛必定教导观能知的心与所知的法，皆是根、尘、识的幻化。此观身心法是佛的善巧方便，所以初学菩萨一定要先观身心入微，然后观幻化。
善男子，彼之众生幻身灭故，幻心亦灭；幻心灭故，幻尘亦灭；幻尘灭故，幻灭亦灭；幻灭灭故，非幻不灭。譬如磨镜，垢尽明现。善男子，当知身心皆为幻垢，垢相永灭，十方清净。
“彼”是指欲求清净圆觉妙心的菩萨修行者，觉悟到“幻身灭故”，即是身体是如幻如化的，是幻身的幻灭，没有实在的身体在灭，“灭”并非从有灭成无，是幻生幻灭。“幻心亦灭”，能知的六识——眼识、耳识、鼻识、舌识、身识、意识等如幻如化的心，也灭了。
“幻心灭故，幻尘亦灭”，是因为六识与六尘是心境互相依存，即能知的心与所知的境互为因缘，只要证悟到任何一方是不生不灭，则一切法皆是“无生”，皆“无相”。
“幻尘灭故，幻灭亦灭”，“幻灭”是指一切如幻如化的生灭，也灭了，即觉悟到生灭幻相本来无生灭相。
“幻灭灭故，非幻不灭”，如果我们是以根、尘、识观察世间，所见皆是有相的生灭幻化，这一切的幻化相都灭了之后，“非幻不灭” 就是见到非幻圆觉妙心一向不生不灭，也就是涅槃不灭。“幻灭灭”即生灭现象灭，也就是证得不生不灭。小乘人以为生灭境界里实有生死轮回，但是当阿罗汉证得不生不灭前，他必定先证悟“幻心灭——幻尘灭——幻灭灭——非幻不灭”，即先证悟生死轮回不实在，才可证悟不生不灭的涅槃。
“非幻不灭”，即证悟不生不灭的当下，不可以没有能觉悟不生灭的心，此时此心称为“根本智”。
在如来藏法门里，“非幻”是指圆觉妙心，是本有的法性，不从修行得来；在其他法门里认为智慧不是本有的，是从修证得来。唯识宗则说转识成智，即把污染的心转成清净的智慧；但是本经说，圆觉妙心本智慧，一向来皆清净。
“譬如磨镜，垢尽明现”，好像磨镜子，污垢尽除，就显现明亮的本质。“当知身心皆为幻垢”，镜子与污垢譬喻智慧与身心，智慧本来清净犹如镜子，妄执六根…
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