全稱二種種子。真言之阿等一字，生無量之義，譬如草木之種子，故稱種子。瑜只經疏卷二（大六一·四九五上）：“佛部以豙（阿）爲種子，成率都婆；蓮花部以高（啰）爲種子，成八葉蓮花（中略）若秘密法品以逘（娑）爲蓮花部種子；金剛部以釯（縛）爲種子，成五股金剛。”

唯識家言，種子是由前七轉識熏習所成，與能、所熏不可分割（前七識爲能熏，第八本識爲所熏），而表現爲體與相、因與果之關系。亦即種子依附在本識體上，成爲本識相分之一分；同時種子隨逐本識潛滋暗長，一遇現緣引發，便騰躍而生，現起轉識，是之謂由種子生起現行。譬如人體之行動，口中之語言，心裏之意想，都能印在心中，稱爲業，或稱種子，遇緣之助力即能發起現行。　　

　　(一)約唯識宗言，依種子之性質，分爲二類：(1)名言種子，系依名言熏習第八識之種子，乃爲一切善惡諸法顯現之親因緣。(2)業種子，第六意識善惡業之種子，具有助長其他羸弱、無記種子現行之功能。　　

　　(二)依種子之生起而分，有二，即：(1)本有種子，即無始以來，在第八識中産生蘊處界之功能者。(2)新熏種子，即無始以來，由現行之前七識，熏習第八識後所聚集染淨之種子。　　

　　(叁)依漏之有無，複可分爲有漏種子與無漏種子二種。［成唯識論卷八］（參閱“種子”5863）　　

　　（名數）一、名言種子，爲現行一切善惡諸法親因之種子。善種子生善法，惡種子生惡法，無記種子生而無記法，乃至由色種生色法，由心種生心法等，依附于第八阿賴耶識則而爲一切諸法之親因者是也。名之爲名言者，或自發名言，而诠顯色心之諸法，于自心之前，反現彼諸法之相分，而熏彼諸法種子于阿賴耶識，或聞他之名言所诠色心之法，于自心之目前反現其相分，以熏彼種子于本識。蓋以名言爲介成此種子之新熏，故謂之名言種子（是表義名言之義）。又，名言種子者，不特介能诠之言語而熏習之，凡一切之心心所，緣諸境時，亦反現其諸境之相分于心前，以熏其種子于本識也。如此依心心所緣境而熏成其種子者，亦名名言種子。名之爲名言者，以心心所緣境時，能緣之心，了顯所對之境，恰如名言诠顯諸法之體義也，因是又名之爲顯境名言。此中第一種之表義名言，限于第六識，以名言緣名言，唯爲第六識相應之尋伺力也，第二種之顯境，通于于七識以了所緣之境而熏種子，通于一切之心心所也。但第八識爲所熏處，自無能熏之用。二、業種子，爲第六識相應之思心所，作善惡之業，熏習第八識之種子。業者，造作之義，造作善惡所熏，善惡之種子也，此思心所之種子，有二功能，一爲自生思心所之功能，名言種子也，二爲助他羸劣無記之種子，使生現行之功能，此名爲業種子，蓋生自果者，非爲業種，助他果使生之功能，乃名爲業種子也。其助他果之法，第八識爲叁性中極劣無記之識體，故能生之名言種子，亦爲羸劣無記之種子，自無生果之力用，然依第六識相應之思心所造作五戒十善等善事之力，使彼第八識無記之種子，決定可生于當來善趣之功能，爲彼之業力所助，自生善起之無記之果也。故名言種子通于八識，且通于叁性，業種子局于第六識之思心所，且局于善惡之二性，以無記羸劣，無助他之功能也，又思心所，兼名言業種之二能，他之心心所法，惟有名言種子之功能而已。見唯識論八，百法問答鈔叁。